Protein–RNA interactions for Protein: P32881

IFNA8, Interferon alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA8P32881 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFNA8P32881 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFNA8P32881 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFNA8P32881 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFNA8P32881 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFNA8P32881 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFNA8P32881 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFNA8P32881 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFNA8P32881 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFNA8P32881 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFNA8P32881 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFNA8P32881 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFNA8P32881 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFNA8P32881 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFNA8P32881 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFNA8P32881 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFNA8P32881 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFNA8P32881 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFNA8P32881 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFNA8P32881 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFNA8P32881 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFNA8P32881 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFNA8P32881 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
IFNA8P32881 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFNA8P32881 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFNA8P32881 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFNA8P32881 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFNA8P32881 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFNA8P32881 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
IFNA8P32881 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
IFNA8P32881 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFNA8P32881 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFNA8P32881 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFNA8P32881 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFNA8P32881 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFNA8P32881 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFNA8P32881 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFNA8P32881 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFNA8P32881 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFNA8P32881 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFNA8P32881 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFNA8P32881 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
IFNA8P32881 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFNA8P32881 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFNA8P32881 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFNA8P32881 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFNA8P32881 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFNA8P32881 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFNA8P32881 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFNA8P32881 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFNA8P32881 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFNA8P32881 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFNA8P32881 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFNA8P32881 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFNA8P32881 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFNA8P32881 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFNA8P32881 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IFNA8P32881 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IFNA8P32881 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFNA8P32881 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
IFNA8P32881 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IFNA8P32881 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IFNA8P32881 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IFNA8P32881 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IFNA8P32881 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IFNA8P32881 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IFNA8P32881 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFNA8P32881 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFNA8P32881 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFNA8P32881 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFNA8P32881 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFNA8P32881 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
IFNA8P32881 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFNA8P32881 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFNA8P32881 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFNA8P32881 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFNA8P32881 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFNA8P32881 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFNA8P32881 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFNA8P32881 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFNA8P32881 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFNA8P32881 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFNA8P32881 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFNA8P32881 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFNA8P32881 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFNA8P32881 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFNA8P32881 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFNA8P32881 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFNA8P32881 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
IFNA8P32881 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFNA8P32881 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFNA8P32881 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFNA8P32881 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
IFNA8P32881 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFNA8P32881 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFNA8P32881 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFNA8P32881 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFNA8P32881 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFNA8P32881 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFNA8P32881 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms