Protein–RNA interactions for Protein: P30988

CALCR, Calcitonin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCRP30988 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALCRP30988 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALCRP30988 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALCRP30988 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALCRP30988 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALCRP30988 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALCRP30988 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALCRP30988 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
CALCRP30988 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALCRP30988 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALCRP30988 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CALCRP30988 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CALCRP30988 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CALCRP30988 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CALCRP30988 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALCRP30988 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALCRP30988 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALCRP30988 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALCRP30988 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALCRP30988 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALCRP30988 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALCRP30988 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALCRP30988 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CALCRP30988 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CALCRP30988 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CALCRP30988 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CALCRP30988 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CALCRP30988 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CALCRP30988 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CALCRP30988 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CALCRP30988 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CALCRP30988 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CALCRP30988 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CALCRP30988 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CALCRP30988 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CALCRP30988 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALCRP30988 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALCRP30988 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALCRP30988 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CALCRP30988 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CALCRP30988 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CALCRP30988 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CALCRP30988 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CALCRP30988 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CALCRP30988 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CALCRP30988 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CALCRP30988 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CALCRP30988 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALCRP30988 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALCRP30988 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALCRP30988 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CALCRP30988 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CALCRP30988 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CALCRP30988 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALCRP30988 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CALCRP30988 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CALCRP30988 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CALCRP30988 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CALCRP30988 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CALCRP30988 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALCRP30988 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALCRP30988 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALCRP30988 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALCRP30988 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CALCRP30988 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CALCRP30988 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CALCRP30988 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALCRP30988 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALCRP30988 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALCRP30988 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALCRP30988 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CALCRP30988 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CALCRP30988 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CALCRP30988 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CALCRP30988 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALCRP30988 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALCRP30988 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALCRP30988 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALCRP30988 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CALCRP30988 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALCRP30988 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALCRP30988 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CALCRP30988 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CALCRP30988 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CALCRP30988 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CALCRP30988 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CALCRP30988 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CALCRP30988 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CALCRP30988 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CALCRP30988 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CALCRP30988 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CALCRP30988 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CALCRP30988 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CALCRP30988 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CALCRP30988 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CALCRP30988 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CALCRP30988 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CALCRP30988 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CALCRP30988 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CALCRP30988 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms