Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
SSFA2P28290 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
SSFA2P28290 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
SSFA2P28290 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
SSFA2P28290 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
SSFA2P28290 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
SSFA2P28290 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
SSFA2P28290 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
SSFA2P28290 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
SSFA2P28290 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
SSFA2P28290 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
SSFA2P28290 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
SSFA2P28290 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
SSFA2P28290 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
SSFA2P28290 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
SSFA2P28290 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
SSFA2P28290 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
SSFA2P28290 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
SSFA2P28290 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
SSFA2P28290 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
SSFA2P28290 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
SSFA2P28290 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
SSFA2P28290 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
SSFA2P28290 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
SSFA2P28290 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
SSFA2P28290 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
SSFA2P28290 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
SSFA2P28290 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
SSFA2P28290 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
SSFA2P28290 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
SSFA2P28290 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
SSFA2P28290 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
SSFA2P28290 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
SSFA2P28290 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
SSFA2P28290 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
SSFA2P28290 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
SSFA2P28290 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
SSFA2P28290 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
SSFA2P28290 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
SSFA2P28290 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
SSFA2P28290 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
SSFA2P28290 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC33.17■■■□□ 2.9
SSFA2P28290 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
SSFA2P28290 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
SSFA2P28290 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
SSFA2P28290 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
SSFA2P28290 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
SSFA2P28290 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
SSFA2P28290 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
SSFA2P28290 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
SSFA2P28290 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
SSFA2P28290 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
SSFA2P28290 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC33.13■■■□□ 2.89
SSFA2P28290 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
SSFA2P28290 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
SSFA2P28290 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
SSFA2P28290 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
SSFA2P28290 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
SSFA2P28290 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
SSFA2P28290 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
SSFA2P28290 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
SSFA2P28290 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
SSFA2P28290 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
SSFA2P28290 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
SSFA2P28290 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
SSFA2P28290 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
SSFA2P28290 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
SSFA2P28290 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
SSFA2P28290 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC33.07■■■□□ 2.88
SSFA2P28290 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
SSFA2P28290 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
SSFA2P28290 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
SSFA2P28290 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
SSFA2P28290 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
SSFA2P28290 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
SSFA2P28290 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
SSFA2P28290 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
SSFA2P28290 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC33.04■■■□□ 2.88
SSFA2P28290 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
SSFA2P28290 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
SSFA2P28290 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
SSFA2P28290 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
SSFA2P28290 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
SSFA2P28290 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
SSFA2P28290 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.87
SSFA2P28290 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.87
SSFA2P28290 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
SSFA2P28290 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
SSFA2P28290 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC33.01■■■□□ 2.87
SSFA2P28290 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
SSFA2P28290 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
SSFA2P28290 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
SSFA2P28290 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
SSFA2P28290 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
SSFA2P28290 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
SSFA2P28290 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
SSFA2P28290 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
SSFA2P28290 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
SSFA2P28290 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
SSFA2P28290 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms