Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HLA-DMAP28067 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HLA-DMAP28067 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HLA-DMAP28067 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HLA-DMAP28067 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HLA-DMAP28067 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HLA-DMAP28067 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HLA-DMAP28067 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HLA-DMAP28067 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HLA-DMAP28067 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HLA-DMAP28067 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HLA-DMAP28067 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HLA-DMAP28067 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-DMAP28067 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-DMAP28067 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-DMAP28067 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-DMAP28067 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HLA-DMAP28067 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HLA-DMAP28067 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HLA-DMAP28067 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HLA-DMAP28067 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HLA-DMAP28067 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HLA-DMAP28067 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HLA-DMAP28067 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-DMAP28067 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-DMAP28067 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-DMAP28067 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-DMAP28067 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-DMAP28067 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-DMAP28067 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-DMAP28067 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-DMAP28067 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-DMAP28067 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-DMAP28067 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-DMAP28067 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-DMAP28067 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-DMAP28067 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-DMAP28067 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
HLA-DMAP28067 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-DMAP28067 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-DMAP28067 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-DMAP28067 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-DMAP28067 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-DMAP28067 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-DMAP28067 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-DMAP28067 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-DMAP28067 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-DMAP28067 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-DMAP28067 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-DMAP28067 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-DMAP28067 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-DMAP28067 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-DMAP28067 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-DMAP28067 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLA-DMAP28067 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLA-DMAP28067 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HLA-DMAP28067 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLA-DMAP28067 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLA-DMAP28067 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLA-DMAP28067 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLA-DMAP28067 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLA-DMAP28067 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLA-DMAP28067 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HLA-DMAP28067 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HLA-DMAP28067 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HLA-DMAP28067 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HLA-DMAP28067 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HLA-DMAP28067 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HLA-DMAP28067 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HLA-DMAP28067 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HLA-DMAP28067 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HLA-DMAP28067 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HLA-DMAP28067 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HLA-DMAP28067 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HLA-DMAP28067 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HLA-DMAP28067 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HLA-DMAP28067 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLA-DMAP28067 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLA-DMAP28067 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLA-DMAP28067 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLA-DMAP28067 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLA-DMAP28067 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HLA-DMAP28067 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HLA-DMAP28067 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HLA-DMAP28067 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HLA-DMAP28067 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HLA-DMAP28067 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HLA-DMAP28067 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HLA-DMAP28067 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HLA-DMAP28067 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HLA-DMAP28067 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HLA-DMAP28067 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HLA-DMAP28067 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HLA-DMAP28067 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HLA-DMAP28067 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HLA-DMAP28067 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HLA-DMAP28067 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HLA-DMAP28067 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HLA-DMAP28067 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HLA-DMAP28067 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms