Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NFKBIAP25963 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NFKBIAP25963 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NFKBIAP25963 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NFKBIAP25963 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NFKBIAP25963 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
NFKBIAP25963 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NFKBIAP25963 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NFKBIAP25963 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NFKBIAP25963 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NFKBIAP25963 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NFKBIAP25963 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NFKBIAP25963 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NFKBIAP25963 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NFKBIAP25963 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NFKBIAP25963 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NFKBIAP25963 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
NFKBIAP25963 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
NFKBIAP25963 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
NFKBIAP25963 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
NFKBIAP25963 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
NFKBIAP25963 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
NFKBIAP25963 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
NFKBIAP25963 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
NFKBIAP25963 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
NFKBIAP25963 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NFKBIAP25963 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NFKBIAP25963 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NFKBIAP25963 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NFKBIAP25963 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NFKBIAP25963 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NFKBIAP25963 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NFKBIAP25963 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NFKBIAP25963 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NFKBIAP25963 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NFKBIAP25963 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NFKBIAP25963 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NFKBIAP25963 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NFKBIAP25963 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NFKBIAP25963 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NFKBIAP25963 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NFKBIAP25963 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NFKBIAP25963 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NFKBIAP25963 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NFKBIAP25963 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NFKBIAP25963 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NFKBIAP25963 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NFKBIAP25963 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NFKBIAP25963 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NFKBIAP25963 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NFKBIAP25963 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NFKBIAP25963 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NFKBIAP25963 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NFKBIAP25963 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NFKBIAP25963 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NFKBIAP25963 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NFKBIAP25963 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NFKBIAP25963 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NFKBIAP25963 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NFKBIAP25963 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NFKBIAP25963 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NFKBIAP25963 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NFKBIAP25963 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NFKBIAP25963 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NFKBIAP25963 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NFKBIAP25963 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NFKBIAP25963 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NFKBIAP25963 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NFKBIAP25963 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NFKBIAP25963 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NFKBIAP25963 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NFKBIAP25963 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NFKBIAP25963 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NFKBIAP25963 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NFKBIAP25963 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NFKBIAP25963 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NFKBIAP25963 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NFKBIAP25963 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NFKBIAP25963 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NFKBIAP25963 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NFKBIAP25963 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NFKBIAP25963 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
NFKBIAP25963 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NFKBIAP25963 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NFKBIAP25963 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
NFKBIAP25963 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NFKBIAP25963 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NFKBIAP25963 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NFKBIAP25963 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NFKBIAP25963 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NFKBIAP25963 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NFKBIAP25963 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NFKBIAP25963 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NFKBIAP25963 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NFKBIAP25963 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
NFKBIAP25963 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NFKBIAP25963 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NFKBIAP25963 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NFKBIAP25963 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NFKBIAP25963 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms