Protein–RNA interactions for Protein: P25106

ACKR3, Atypical chemokine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR3P25106 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ACKR3P25106 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ACKR3P25106 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACKR3P25106 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACKR3P25106 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACKR3P25106 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACKR3P25106 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACKR3P25106 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ACKR3P25106 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ACKR3P25106 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACKR3P25106 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACKR3P25106 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACKR3P25106 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACKR3P25106 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACKR3P25106 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACKR3P25106 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACKR3P25106 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACKR3P25106 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACKR3P25106 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACKR3P25106 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACKR3P25106 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ACKR3P25106 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ACKR3P25106 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACKR3P25106 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ACKR3P25106 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACKR3P25106 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACKR3P25106 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACKR3P25106 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACKR3P25106 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACKR3P25106 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ACKR3P25106 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACKR3P25106 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACKR3P25106 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACKR3P25106 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACKR3P25106 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACKR3P25106 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACKR3P25106 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACKR3P25106 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ACKR3P25106 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACKR3P25106 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACKR3P25106 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACKR3P25106 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACKR3P25106 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACKR3P25106 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACKR3P25106 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACKR3P25106 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACKR3P25106 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACKR3P25106 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACKR3P25106 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACKR3P25106 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACKR3P25106 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACKR3P25106 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACKR3P25106 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACKR3P25106 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACKR3P25106 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACKR3P25106 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACKR3P25106 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACKR3P25106 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACKR3P25106 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACKR3P25106 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ACKR3P25106 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACKR3P25106 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACKR3P25106 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACKR3P25106 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACKR3P25106 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACKR3P25106 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACKR3P25106 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACKR3P25106 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACKR3P25106 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACKR3P25106 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACKR3P25106 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACKR3P25106 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACKR3P25106 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ACKR3P25106 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACKR3P25106 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACKR3P25106 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACKR3P25106 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACKR3P25106 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACKR3P25106 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACKR3P25106 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ACKR3P25106 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ACKR3P25106 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACKR3P25106 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACKR3P25106 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACKR3P25106 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACKR3P25106 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACKR3P25106 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACKR3P25106 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACKR3P25106 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACKR3P25106 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACKR3P25106 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACKR3P25106 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACKR3P25106 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACKR3P25106 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACKR3P25106 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ACKR3P25106 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ACKR3P25106 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACKR3P25106 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACKR3P25106 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACKR3P25106 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms