Protein–RNA interactions for Protein: P22415

USF1, Upstream stimulatory factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF1P22415 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
USF1P22415 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
USF1P22415 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USF1P22415 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USF1P22415 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USF1P22415 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USF1P22415 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USF1P22415 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
USF1P22415 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
USF1P22415 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
USF1P22415 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
USF1P22415 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
USF1P22415 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USF1P22415 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USF1P22415 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USF1P22415 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USF1P22415 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USF1P22415 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USF1P22415 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USF1P22415 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
USF1P22415 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
USF1P22415 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USF1P22415 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USF1P22415 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
USF1P22415 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USF1P22415 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USF1P22415 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USF1P22415 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USF1P22415 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USF1P22415 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USF1P22415 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USF1P22415 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USF1P22415 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USF1P22415 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USF1P22415 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USF1P22415 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USF1P22415 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USF1P22415 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USF1P22415 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USF1P22415 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USF1P22415 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USF1P22415 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USF1P22415 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USF1P22415 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USF1P22415 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USF1P22415 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USF1P22415 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USF1P22415 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USF1P22415 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
USF1P22415 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USF1P22415 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
USF1P22415 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
USF1P22415 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USF1P22415 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USF1P22415 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USF1P22415 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USF1P22415 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USF1P22415 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USF1P22415 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USF1P22415 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
USF1P22415 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USF1P22415 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USF1P22415 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USF1P22415 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USF1P22415 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USF1P22415 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USF1P22415 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USF1P22415 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USF1P22415 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USF1P22415 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USF1P22415 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USF1P22415 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USF1P22415 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USF1P22415 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
USF1P22415 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USF1P22415 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USF1P22415 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USF1P22415 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USF1P22415 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USF1P22415 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USF1P22415 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USF1P22415 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
USF1P22415 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USF1P22415 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USF1P22415 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USF1P22415 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USF1P22415 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USF1P22415 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USF1P22415 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USF1P22415 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USF1P22415 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USF1P22415 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USF1P22415 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
USF1P22415 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USF1P22415 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USF1P22415 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USF1P22415 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USF1P22415 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USF1P22415 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USF1P22415 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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