Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC9A1P19634 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC9A1P19634 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC9A1P19634 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLC9A1P19634 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLC9A1P19634 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLC9A1P19634 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLC9A1P19634 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLC9A1P19634 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLC9A1P19634 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLC9A1P19634 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLC9A1P19634 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLC9A1P19634 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLC9A1P19634 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SLC9A1P19634 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLC9A1P19634 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC9A1P19634 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC9A1P19634 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC9A1P19634 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC9A1P19634 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC9A1P19634 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC9A1P19634 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC9A1P19634 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC9A1P19634 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC9A1P19634 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC9A1P19634 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC9A1P19634 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC9A1P19634 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC9A1P19634 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC9A1P19634 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC9A1P19634 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC9A1P19634 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC9A1P19634 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC9A1P19634 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC9A1P19634 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC9A1P19634 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC9A1P19634 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SLC9A1P19634 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SLC9A1P19634 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SLC9A1P19634 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SLC9A1P19634 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC9A1P19634 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC9A1P19634 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC9A1P19634 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC9A1P19634 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC9A1P19634 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC9A1P19634 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC9A1P19634 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC9A1P19634 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC9A1P19634 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC9A1P19634 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC9A1P19634 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC9A1P19634 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC9A1P19634 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC9A1P19634 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC9A1P19634 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SLC9A1P19634 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SLC9A1P19634 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
SLC9A1P19634 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC9A1P19634 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC9A1P19634 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC9A1P19634 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC9A1P19634 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC9A1P19634 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC9A1P19634 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC9A1P19634 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC9A1P19634 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC9A1P19634 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC9A1P19634 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC9A1P19634 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC9A1P19634 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC9A1P19634 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC9A1P19634 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC9A1P19634 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC9A1P19634 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC9A1P19634 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC9A1P19634 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC9A1P19634 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC9A1P19634 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC9A1P19634 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SLC9A1P19634 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC9A1P19634 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC9A1P19634 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC9A1P19634 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLC9A1P19634 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SLC9A1P19634 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SLC9A1P19634 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLC9A1P19634 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLC9A1P19634 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLC9A1P19634 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLC9A1P19634 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SLC9A1P19634 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLC9A1P19634 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SLC9A1P19634 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SLC9A1P19634 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
SLC9A1P19634 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLC9A1P19634 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SLC9A1P19634 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLC9A1P19634 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SLC9A1P19634 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms