Protein–RNA interactions for Protein: P19113

HDC, Histidine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDCP19113 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HDCP19113 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HDCP19113 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HDCP19113 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HDCP19113 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HDCP19113 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HDCP19113 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HDCP19113 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HDCP19113 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HDCP19113 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
HDCP19113 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HDCP19113 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
HDCP19113 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HDCP19113 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HDCP19113 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
HDCP19113 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HDCP19113 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HDCP19113 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
HDCP19113 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HDCP19113 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HDCP19113 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HDCP19113 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HDCP19113 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HDCP19113 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HDCP19113 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HDCP19113 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HDCP19113 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HDCP19113 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HDCP19113 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HDCP19113 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HDCP19113 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HDCP19113 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HDCP19113 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HDCP19113 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HDCP19113 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HDCP19113 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HDCP19113 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HDCP19113 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HDCP19113 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HDCP19113 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HDCP19113 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HDCP19113 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HDCP19113 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
HDCP19113 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
HDCP19113 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HDCP19113 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HDCP19113 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HDCP19113 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HDCP19113 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HDCP19113 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HDCP19113 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HDCP19113 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HDCP19113 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HDCP19113 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HDCP19113 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HDCP19113 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HDCP19113 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HDCP19113 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HDCP19113 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HDCP19113 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
HDCP19113 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
HDCP19113 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HDCP19113 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HDCP19113 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HDCP19113 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HDCP19113 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HDCP19113 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HDCP19113 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HDCP19113 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HDCP19113 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HDCP19113 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HDCP19113 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HDCP19113 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HDCP19113 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HDCP19113 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HDCP19113 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HDCP19113 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HDCP19113 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HDCP19113 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HDCP19113 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HDCP19113 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HDCP19113 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HDCP19113 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HDCP19113 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HDCP19113 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HDCP19113 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HDCP19113 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HDCP19113 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HDCP19113 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HDCP19113 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HDCP19113 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HDCP19113 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HDCP19113 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HDCP19113 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HDCP19113 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HDCP19113 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HDCP19113 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HDCP19113 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HDCP19113 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HDCP19113 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 233.2 ms