Protein–RNA interactions for Protein: P17658

KCNA6, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 6, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA6P17658 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC36.89■■■■□ 3.5
KCNA6P17658 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC36.89■■■■□ 3.5
KCNA6P17658 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
KCNA6P17658 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
KCNA6P17658 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
KCNA6P17658 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC36.86■■■■□ 3.49
KCNA6P17658 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
KCNA6P17658 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
KCNA6P17658 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
KCNA6P17658 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
KCNA6P17658 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
KCNA6P17658 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC36.85■■■■□ 3.49
KCNA6P17658 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
KCNA6P17658 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
KCNA6P17658 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
KCNA6P17658 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
KCNA6P17658 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
KCNA6P17658 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
KCNA6P17658 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
KCNA6P17658 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
KCNA6P17658 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
KCNA6P17658 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
KCNA6P17658 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
KCNA6P17658 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
KCNA6P17658 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.8■■■■□ 3.48
KCNA6P17658 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
KCNA6P17658 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
KCNA6P17658 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
KCNA6P17658 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
KCNA6P17658 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
KCNA6P17658 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
KCNA6P17658 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC36.76■■■■□ 3.48
KCNA6P17658 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
KCNA6P17658 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC36.76■■■■□ 3.48
KCNA6P17658 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
KCNA6P17658 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
KCNA6P17658 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
KCNA6P17658 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
KCNA6P17658 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
KCNA6P17658 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
KCNA6P17658 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
KCNA6P17658 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.73■■■■□ 3.47
KCNA6P17658 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
KCNA6P17658 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
KCNA6P17658 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
KCNA6P17658 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
KCNA6P17658 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
KCNA6P17658 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
KCNA6P17658 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC36.71■■■■□ 3.47
KCNA6P17658 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
KCNA6P17658 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
KCNA6P17658 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
KCNA6P17658 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC36.67■■■■□ 3.46
KCNA6P17658 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
KCNA6P17658 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
KCNA6P17658 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
KCNA6P17658 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
KCNA6P17658 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
KCNA6P17658 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
KCNA6P17658 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
KCNA6P17658 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
KCNA6P17658 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
KCNA6P17658 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
KCNA6P17658 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
KCNA6P17658 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC36.62■■■■□ 3.45
KCNA6P17658 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
KCNA6P17658 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
KCNA6P17658 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
KCNA6P17658 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
KCNA6P17658 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
KCNA6P17658 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
KCNA6P17658 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC36.61■■■■□ 3.45
KCNA6P17658 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
KCNA6P17658 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
KCNA6P17658 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC36.6■■■■□ 3.45
KCNA6P17658 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC36.6■■■■□ 3.45
KCNA6P17658 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
KCNA6P17658 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
KCNA6P17658 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
KCNA6P17658 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
KCNA6P17658 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
KCNA6P17658 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.56■■■■□ 3.44
KCNA6P17658 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
KCNA6P17658 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
KCNA6P17658 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
KCNA6P17658 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
KCNA6P17658 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
KCNA6P17658 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
KCNA6P17658 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
KCNA6P17658 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
KCNA6P17658 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
KCNA6P17658 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
KCNA6P17658 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
KCNA6P17658 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC36.52■■■■□ 3.44
KCNA6P17658 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
KCNA6P17658 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
KCNA6P17658 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
KCNA6P17658 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
KCNA6P17658 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
KCNA6P17658 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms