Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTLA4P16410 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTLA4P16410 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTLA4P16410 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTLA4P16410 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CTLA4P16410 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CTLA4P16410 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTLA4P16410 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTLA4P16410 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTLA4P16410 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTLA4P16410 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTLA4P16410 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTLA4P16410 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTLA4P16410 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTLA4P16410 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTLA4P16410 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTLA4P16410 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTLA4P16410 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTLA4P16410 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTLA4P16410 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTLA4P16410 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTLA4P16410 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTLA4P16410 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTLA4P16410 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTLA4P16410 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTLA4P16410 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTLA4P16410 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTLA4P16410 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTLA4P16410 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTLA4P16410 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTLA4P16410 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTLA4P16410 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTLA4P16410 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTLA4P16410 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTLA4P16410 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTLA4P16410 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CTLA4P16410 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTLA4P16410 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTLA4P16410 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CTLA4P16410 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTLA4P16410 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTLA4P16410 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CTLA4P16410 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTLA4P16410 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTLA4P16410 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTLA4P16410 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTLA4P16410 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTLA4P16410 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTLA4P16410 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTLA4P16410 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTLA4P16410 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTLA4P16410 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTLA4P16410 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTLA4P16410 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTLA4P16410 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTLA4P16410 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CTLA4P16410 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTLA4P16410 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CTLA4P16410 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTLA4P16410 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTLA4P16410 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTLA4P16410 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CTLA4P16410 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CTLA4P16410 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTLA4P16410 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTLA4P16410 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTLA4P16410 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTLA4P16410 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTLA4P16410 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTLA4P16410 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTLA4P16410 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTLA4P16410 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTLA4P16410 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTLA4P16410 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTLA4P16410 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTLA4P16410 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTLA4P16410 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTLA4P16410 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTLA4P16410 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTLA4P16410 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTLA4P16410 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTLA4P16410 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CTLA4P16410 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CTLA4P16410 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTLA4P16410 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTLA4P16410 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTLA4P16410 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTLA4P16410 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTLA4P16410 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTLA4P16410 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTLA4P16410 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CTLA4P16410 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTLA4P16410 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTLA4P16410 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CTLA4P16410 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTLA4P16410 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CTLA4P16410 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTLA4P16410 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTLA4P16410 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTLA4P16410 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms