Protein–RNA interactions for Protein: P15863

PAX1, Paired box protein Pax-1, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX1P15863 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PAX1P15863 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PAX1P15863 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PAX1P15863 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PAX1P15863 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PAX1P15863 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PAX1P15863 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PAX1P15863 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PAX1P15863 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PAX1P15863 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PAX1P15863 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PAX1P15863 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PAX1P15863 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PAX1P15863 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PAX1P15863 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PAX1P15863 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PAX1P15863 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PAX1P15863 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PAX1P15863 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PAX1P15863 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PAX1P15863 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PAX1P15863 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PAX1P15863 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PAX1P15863 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PAX1P15863 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PAX1P15863 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PAX1P15863 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PAX1P15863 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PAX1P15863 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PAX1P15863 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PAX1P15863 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PAX1P15863 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PAX1P15863 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAX1P15863 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAX1P15863 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAX1P15863 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAX1P15863 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PAX1P15863 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PAX1P15863 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PAX1P15863 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PAX1P15863 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PAX1P15863 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PAX1P15863 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PAX1P15863 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PAX1P15863 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PAX1P15863 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PAX1P15863 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PAX1P15863 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PAX1P15863 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PAX1P15863 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PAX1P15863 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PAX1P15863 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PAX1P15863 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PAX1P15863 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PAX1P15863 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PAX1P15863 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PAX1P15863 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PAX1P15863 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PAX1P15863 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PAX1P15863 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PAX1P15863 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PAX1P15863 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PAX1P15863 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PAX1P15863 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PAX1P15863 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PAX1P15863 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PAX1P15863 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PAX1P15863 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PAX1P15863 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PAX1P15863 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PAX1P15863 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PAX1P15863 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PAX1P15863 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PAX1P15863 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PAX1P15863 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PAX1P15863 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PAX1P15863 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PAX1P15863 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PAX1P15863 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PAX1P15863 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PAX1P15863 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PAX1P15863 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PAX1P15863 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PAX1P15863 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PAX1P15863 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PAX1P15863 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PAX1P15863 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PAX1P15863 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PAX1P15863 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PAX1P15863 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PAX1P15863 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PAX1P15863 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PAX1P15863 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PAX1P15863 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PAX1P15863 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PAX1P15863 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PAX1P15863 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PAX1P15863 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PAX1P15863 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PAX1P15863 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms