Protein–RNA interactions for Protein: P12544

GZMA, Granzyme A, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GZMAP12544 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GZMAP12544 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GZMAP12544 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GZMAP12544 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GZMAP12544 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GZMAP12544 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GZMAP12544 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
GZMAP12544 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GZMAP12544 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GZMAP12544 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GZMAP12544 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GZMAP12544 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GZMAP12544 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GZMAP12544 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
GZMAP12544 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GZMAP12544 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
GZMAP12544 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GZMAP12544 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GZMAP12544 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GZMAP12544 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GZMAP12544 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GZMAP12544 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GZMAP12544 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GZMAP12544 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GZMAP12544 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GZMAP12544 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GZMAP12544 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GZMAP12544 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
GZMAP12544 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
GZMAP12544 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GZMAP12544 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GZMAP12544 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GZMAP12544 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GZMAP12544 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GZMAP12544 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GZMAP12544 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GZMAP12544 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GZMAP12544 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GZMAP12544 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GZMAP12544 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GZMAP12544 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GZMAP12544 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GZMAP12544 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GZMAP12544 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GZMAP12544 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GZMAP12544 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GZMAP12544 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GZMAP12544 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GZMAP12544 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GZMAP12544 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GZMAP12544 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GZMAP12544 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GZMAP12544 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GZMAP12544 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GZMAP12544 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GZMAP12544 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GZMAP12544 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
GZMAP12544 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GZMAP12544 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GZMAP12544 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GZMAP12544 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GZMAP12544 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GZMAP12544 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
GZMAP12544 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GZMAP12544 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
GZMAP12544 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GZMAP12544 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GZMAP12544 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
GZMAP12544 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GZMAP12544 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GZMAP12544 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GZMAP12544 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GZMAP12544 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
GZMAP12544 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GZMAP12544 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GZMAP12544 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GZMAP12544 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GZMAP12544 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GZMAP12544 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GZMAP12544 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GZMAP12544 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GZMAP12544 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
GZMAP12544 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GZMAP12544 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GZMAP12544 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GZMAP12544 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
GZMAP12544 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
GZMAP12544 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GZMAP12544 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GZMAP12544 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27■■□□□ 1.91
GZMAP12544 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GZMAP12544 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GZMAP12544 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GZMAP12544 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GZMAP12544 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GZMAP12544 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GZMAP12544 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GZMAP12544 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GZMAP12544 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GZMAP12544 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.1 ms