Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SFTPCP11686 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SFTPCP11686 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SFTPCP11686 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SFTPCP11686 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SFTPCP11686 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SFTPCP11686 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SFTPCP11686 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SFTPCP11686 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SFTPCP11686 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SFTPCP11686 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SFTPCP11686 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SFTPCP11686 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SFTPCP11686 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SFTPCP11686 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SFTPCP11686 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SFTPCP11686 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SFTPCP11686 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SFTPCP11686 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SFTPCP11686 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SFTPCP11686 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SFTPCP11686 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SFTPCP11686 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SFTPCP11686 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SFTPCP11686 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SFTPCP11686 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SFTPCP11686 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SFTPCP11686 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SFTPCP11686 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SFTPCP11686 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SFTPCP11686 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SFTPCP11686 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SFTPCP11686 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SFTPCP11686 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SFTPCP11686 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SFTPCP11686 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SFTPCP11686 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SFTPCP11686 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SFTPCP11686 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SFTPCP11686 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SFTPCP11686 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SFTPCP11686 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SFTPCP11686 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SFTPCP11686 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SFTPCP11686 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SFTPCP11686 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SFTPCP11686 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SFTPCP11686 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SFTPCP11686 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SFTPCP11686 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SFTPCP11686 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SFTPCP11686 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SFTPCP11686 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SFTPCP11686 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SFTPCP11686 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SFTPCP11686 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SFTPCP11686 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SFTPCP11686 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SFTPCP11686 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SFTPCP11686 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SFTPCP11686 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SFTPCP11686 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SFTPCP11686 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SFTPCP11686 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SFTPCP11686 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SFTPCP11686 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SFTPCP11686 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SFTPCP11686 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SFTPCP11686 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SFTPCP11686 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SFTPCP11686 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SFTPCP11686 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SFTPCP11686 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SFTPCP11686 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SFTPCP11686 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SFTPCP11686 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SFTPCP11686 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SFTPCP11686 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SFTPCP11686 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SFTPCP11686 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SFTPCP11686 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SFTPCP11686 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SFTPCP11686 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SFTPCP11686 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SFTPCP11686 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SFTPCP11686 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SFTPCP11686 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SFTPCP11686 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SFTPCP11686 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SFTPCP11686 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SFTPCP11686 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SFTPCP11686 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SFTPCP11686 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SFTPCP11686 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SFTPCP11686 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SFTPCP11686 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SFTPCP11686 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SFTPCP11686 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SFTPCP11686 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SFTPCP11686 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 180.2 ms