Protein–RNA interactions for Protein: P11229

CHRM1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRM1P11229 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHRM1P11229 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHRM1P11229 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHRM1P11229 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHRM1P11229 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHRM1P11229 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHRM1P11229 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHRM1P11229 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHRM1P11229 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHRM1P11229 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHRM1P11229 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHRM1P11229 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CHRM1P11229 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CHRM1P11229 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CHRM1P11229 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CHRM1P11229 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHRM1P11229 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHRM1P11229 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHRM1P11229 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CHRM1P11229 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHRM1P11229 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHRM1P11229 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHRM1P11229 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHRM1P11229 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHRM1P11229 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CHRM1P11229 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHRM1P11229 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHRM1P11229 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHRM1P11229 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHRM1P11229 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHRM1P11229 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHRM1P11229 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHRM1P11229 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHRM1P11229 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHRM1P11229 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHRM1P11229 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHRM1P11229 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CHRM1P11229 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHRM1P11229 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHRM1P11229 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHRM1P11229 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHRM1P11229 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHRM1P11229 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHRM1P11229 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHRM1P11229 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHRM1P11229 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHRM1P11229 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHRM1P11229 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHRM1P11229 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHRM1P11229 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHRM1P11229 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHRM1P11229 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHRM1P11229 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHRM1P11229 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHRM1P11229 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHRM1P11229 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHRM1P11229 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHRM1P11229 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHRM1P11229 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHRM1P11229 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHRM1P11229 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHRM1P11229 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHRM1P11229 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHRM1P11229 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHRM1P11229 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHRM1P11229 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHRM1P11229 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHRM1P11229 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHRM1P11229 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHRM1P11229 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHRM1P11229 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHRM1P11229 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHRM1P11229 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHRM1P11229 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHRM1P11229 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHRM1P11229 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHRM1P11229 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHRM1P11229 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHRM1P11229 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHRM1P11229 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHRM1P11229 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHRM1P11229 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHRM1P11229 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHRM1P11229 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHRM1P11229 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHRM1P11229 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHRM1P11229 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHRM1P11229 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHRM1P11229 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHRM1P11229 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHRM1P11229 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHRM1P11229 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHRM1P11229 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHRM1P11229 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHRM1P11229 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHRM1P11229 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHRM1P11229 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CHRM1P11229 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHRM1P11229 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHRM1P11229 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms