Protein–RNA interactions for Protein: P0C7V6

SUPT20HL2, Putative transcription factor SPT20 homolog-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 817 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUPT20HL2P0C7V6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SUPT20HL2P0C7V6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SUPT20HL2P0C7V6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SUPT20HL2P0C7V6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SUPT20HL2P0C7V6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SUPT20HL2P0C7V6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SUPT20HL2P0C7V6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
SUPT20HL2P0C7V6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SUPT20HL2P0C7V6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SUPT20HL2P0C7V6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SUPT20HL2P0C7V6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SUPT20HL2P0C7V6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SUPT20HL2P0C7V6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SUPT20HL2P0C7V6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SUPT20HL2P0C7V6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SUPT20HL2P0C7V6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SUPT20HL2P0C7V6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SUPT20HL2P0C7V6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SUPT20HL2P0C7V6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
SUPT20HL2P0C7V6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SUPT20HL2P0C7V6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SUPT20HL2P0C7V6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SUPT20HL2P0C7V6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SUPT20HL2P0C7V6 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SUPT20HL2P0C7V6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SUPT20HL2P0C7V6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
SUPT20HL2P0C7V6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SUPT20HL2P0C7V6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
SUPT20HL2P0C7V6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SUPT20HL2P0C7V6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
SUPT20HL2P0C7V6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SUPT20HL2P0C7V6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SUPT20HL2P0C7V6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SUPT20HL2P0C7V6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SUPT20HL2P0C7V6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SUPT20HL2P0C7V6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SUPT20HL2P0C7V6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SUPT20HL2P0C7V6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SUPT20HL2P0C7V6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SUPT20HL2P0C7V6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SUPT20HL2P0C7V6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SUPT20HL2P0C7V6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SUPT20HL2P0C7V6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
SUPT20HL2P0C7V6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SUPT20HL2P0C7V6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SUPT20HL2P0C7V6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SUPT20HL2P0C7V6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SUPT20HL2P0C7V6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SUPT20HL2P0C7V6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SUPT20HL2P0C7V6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SUPT20HL2P0C7V6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SUPT20HL2P0C7V6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SUPT20HL2P0C7V6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SUPT20HL2P0C7V6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SUPT20HL2P0C7V6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SUPT20HL2P0C7V6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SUPT20HL2P0C7V6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SUPT20HL2P0C7V6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SUPT20HL2P0C7V6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SUPT20HL2P0C7V6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SUPT20HL2P0C7V6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SUPT20HL2P0C7V6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SUPT20HL2P0C7V6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SUPT20HL2P0C7V6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SUPT20HL2P0C7V6 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SUPT20HL2P0C7V6 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SUPT20HL2P0C7V6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SUPT20HL2P0C7V6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SUPT20HL2P0C7V6 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SUPT20HL2P0C7V6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SUPT20HL2P0C7V6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SUPT20HL2P0C7V6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SUPT20HL2P0C7V6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SUPT20HL2P0C7V6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SUPT20HL2P0C7V6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SUPT20HL2P0C7V6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SUPT20HL2P0C7V6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
SUPT20HL2P0C7V6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SUPT20HL2P0C7V6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SUPT20HL2P0C7V6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SUPT20HL2P0C7V6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SUPT20HL2P0C7V6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SUPT20HL2P0C7V6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SUPT20HL2P0C7V6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SUPT20HL2P0C7V6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SUPT20HL2P0C7V6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SUPT20HL2P0C7V6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SUPT20HL2P0C7V6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SUPT20HL2P0C7V6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SUPT20HL2P0C7V6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SUPT20HL2P0C7V6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
SUPT20HL2P0C7V6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SUPT20HL2P0C7V6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SUPT20HL2P0C7V6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SUPT20HL2P0C7V6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SUPT20HL2P0C7V6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SUPT20HL2P0C7V6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SUPT20HL2P0C7V6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SUPT20HL2P0C7V6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SUPT20HL2P0C7V6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms