Protein–RNA interactions for Protein: P0C0E4

RAB40AL, Ras-related protein Rab-40A-like, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40ALP0C0E4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB40ALP0C0E4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB40ALP0C0E4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB40ALP0C0E4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB40ALP0C0E4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB40ALP0C0E4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB40ALP0C0E4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB40ALP0C0E4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB40ALP0C0E4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB40ALP0C0E4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB40ALP0C0E4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB40ALP0C0E4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB40ALP0C0E4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB40ALP0C0E4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB40ALP0C0E4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB40ALP0C0E4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB40ALP0C0E4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB40ALP0C0E4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB40ALP0C0E4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB40ALP0C0E4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB40ALP0C0E4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB40ALP0C0E4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB40ALP0C0E4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB40ALP0C0E4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB40ALP0C0E4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB40ALP0C0E4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB40ALP0C0E4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB40ALP0C0E4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB40ALP0C0E4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB40ALP0C0E4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB40ALP0C0E4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB40ALP0C0E4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB40ALP0C0E4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB40ALP0C0E4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB40ALP0C0E4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB40ALP0C0E4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB40ALP0C0E4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB40ALP0C0E4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB40ALP0C0E4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB40ALP0C0E4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB40ALP0C0E4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB40ALP0C0E4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB40ALP0C0E4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB40ALP0C0E4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB40ALP0C0E4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB40ALP0C0E4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB40ALP0C0E4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB40ALP0C0E4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB40ALP0C0E4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB40ALP0C0E4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB40ALP0C0E4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RAB40ALP0C0E4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB40ALP0C0E4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB40ALP0C0E4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB40ALP0C0E4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB40ALP0C0E4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB40ALP0C0E4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB40ALP0C0E4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB40ALP0C0E4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB40ALP0C0E4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB40ALP0C0E4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB40ALP0C0E4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB40ALP0C0E4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB40ALP0C0E4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB40ALP0C0E4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB40ALP0C0E4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB40ALP0C0E4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB40ALP0C0E4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB40ALP0C0E4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB40ALP0C0E4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB40ALP0C0E4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB40ALP0C0E4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB40ALP0C0E4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB40ALP0C0E4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB40ALP0C0E4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RAB40ALP0C0E4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
RAB40ALP0C0E4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB40ALP0C0E4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB40ALP0C0E4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB40ALP0C0E4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB40ALP0C0E4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB40ALP0C0E4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB40ALP0C0E4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB40ALP0C0E4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB40ALP0C0E4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB40ALP0C0E4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB40ALP0C0E4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB40ALP0C0E4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB40ALP0C0E4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB40ALP0C0E4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB40ALP0C0E4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB40ALP0C0E4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB40ALP0C0E4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB40ALP0C0E4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB40ALP0C0E4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB40ALP0C0E4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB40ALP0C0E4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB40ALP0C0E4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB40ALP0C0E4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB40ALP0C0E4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90 ms