Protein–RNA interactions for Protein: P09874

PARP1, Poly [ADP-ribose] polymerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP1P09874 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PARP1P09874 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PARP1P09874 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PARP1P09874 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PARP1P09874 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PARP1P09874 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PARP1P09874 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PARP1P09874 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PARP1P09874 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PARP1P09874 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PARP1P09874 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PARP1P09874 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PARP1P09874 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
PARP1P09874 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PARP1P09874 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PARP1P09874 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PARP1P09874 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PARP1P09874 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
PARP1P09874 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PARP1P09874 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PARP1P09874 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PARP1P09874 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PARP1P09874 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PARP1P09874 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PARP1P09874 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PARP1P09874 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PARP1P09874 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PARP1P09874 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
PARP1P09874 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
PARP1P09874 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PARP1P09874 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PARP1P09874 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PARP1P09874 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PARP1P09874 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PARP1P09874 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PARP1P09874 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PARP1P09874 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
PARP1P09874 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PARP1P09874 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PARP1P09874 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PARP1P09874 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PARP1P09874 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PARP1P09874 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PARP1P09874 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PARP1P09874 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PARP1P09874 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PARP1P09874 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PARP1P09874 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PARP1P09874 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PARP1P09874 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PARP1P09874 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
PARP1P09874 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PARP1P09874 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PARP1P09874 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PARP1P09874 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PARP1P09874 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PARP1P09874 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PARP1P09874 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PARP1P09874 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PARP1P09874 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PARP1P09874 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PARP1P09874 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PARP1P09874 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PARP1P09874 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PARP1P09874 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PARP1P09874 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PARP1P09874 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PARP1P09874 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PARP1P09874 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PARP1P09874 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PARP1P09874 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PARP1P09874 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PARP1P09874 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PARP1P09874 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PARP1P09874 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
PARP1P09874 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PARP1P09874 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
PARP1P09874 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
PARP1P09874 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PARP1P09874 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PARP1P09874 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PARP1P09874 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PARP1P09874 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PARP1P09874 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PARP1P09874 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PARP1P09874 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PARP1P09874 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PARP1P09874 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PARP1P09874 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
PARP1P09874 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PARP1P09874 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PARP1P09874 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PARP1P09874 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
PARP1P09874 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PARP1P09874 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
PARP1P09874 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
PARP1P09874 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
PARP1P09874 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PARP1P09874 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PARP1P09874 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 204.8 ms