Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PKHD1P08F94 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PKHD1P08F94 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PKHD1P08F94 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PKHD1P08F94 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PKHD1P08F94 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PKHD1P08F94 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PKHD1P08F94 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PKHD1P08F94 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PKHD1P08F94 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PKHD1P08F94 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PKHD1P08F94 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PKHD1P08F94 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PKHD1P08F94 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PKHD1P08F94 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PKHD1P08F94 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PKHD1P08F94 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PKHD1P08F94 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PKHD1P08F94 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PKHD1P08F94 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PKHD1P08F94 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PKHD1P08F94 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PKHD1P08F94 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PKHD1P08F94 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PKHD1P08F94 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PKHD1P08F94 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PKHD1P08F94 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PKHD1P08F94 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PKHD1P08F94 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PKHD1P08F94 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PKHD1P08F94 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PKHD1P08F94 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PKHD1P08F94 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PKHD1P08F94 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PKHD1P08F94 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PKHD1P08F94 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PKHD1P08F94 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PKHD1P08F94 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PKHD1P08F94 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PKHD1P08F94 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PKHD1P08F94 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PKHD1P08F94 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PKHD1P08F94 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PKHD1P08F94 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PKHD1P08F94 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PKHD1P08F94 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PKHD1P08F94 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PKHD1P08F94 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PKHD1P08F94 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PKHD1P08F94 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PKHD1P08F94 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PKHD1P08F94 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PKHD1P08F94 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PKHD1P08F94 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PKHD1P08F94 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PKHD1P08F94 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PKHD1P08F94 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PKHD1P08F94 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PKHD1P08F94 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PKHD1P08F94 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PKHD1P08F94 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PKHD1P08F94 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PKHD1P08F94 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PKHD1P08F94 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PKHD1P08F94 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PKHD1P08F94 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PKHD1P08F94 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PKHD1P08F94 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PKHD1P08F94 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PKHD1P08F94 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PKHD1P08F94 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PKHD1P08F94 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PKHD1P08F94 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PKHD1P08F94 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PKHD1P08F94 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PKHD1P08F94 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PKHD1P08F94 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PKHD1P08F94 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PKHD1P08F94 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PKHD1P08F94 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PKHD1P08F94 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PKHD1P08F94 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PKHD1P08F94 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PKHD1P08F94 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PKHD1P08F94 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PKHD1P08F94 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PKHD1P08F94 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PKHD1P08F94 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PKHD1P08F94 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PKHD1P08F94 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PKHD1P08F94 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PKHD1P08F94 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PKHD1P08F94 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PKHD1P08F94 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PKHD1P08F94 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PKHD1P08F94 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PKHD1P08F94 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PKHD1P08F94 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PKHD1P08F94 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PKHD1P08F94 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms