Protein–RNA interactions for Protein: P06239

LCK, Tyrosine-protein kinase Lck, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCKP06239 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LCKP06239 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LCKP06239 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LCKP06239 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LCKP06239 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LCKP06239 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LCKP06239 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LCKP06239 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LCKP06239 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LCKP06239 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LCKP06239 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LCKP06239 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
LCKP06239 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LCKP06239 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LCKP06239 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LCKP06239 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LCKP06239 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LCKP06239 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LCKP06239 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LCKP06239 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LCKP06239 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LCKP06239 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LCKP06239 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LCKP06239 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LCKP06239 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LCKP06239 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LCKP06239 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LCKP06239 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LCKP06239 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LCKP06239 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LCKP06239 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LCKP06239 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LCKP06239 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LCKP06239 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LCKP06239 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LCKP06239 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LCKP06239 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LCKP06239 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LCKP06239 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LCKP06239 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LCKP06239 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LCKP06239 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LCKP06239 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LCKP06239 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LCKP06239 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LCKP06239 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LCKP06239 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LCKP06239 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LCKP06239 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LCKP06239 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LCKP06239 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LCKP06239 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LCKP06239 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LCKP06239 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LCKP06239 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LCKP06239 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LCKP06239 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LCKP06239 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LCKP06239 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LCKP06239 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LCKP06239 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LCKP06239 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LCKP06239 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LCKP06239 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LCKP06239 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LCKP06239 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LCKP06239 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LCKP06239 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LCKP06239 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LCKP06239 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LCKP06239 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LCKP06239 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LCKP06239 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LCKP06239 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LCKP06239 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LCKP06239 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LCKP06239 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LCKP06239 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LCKP06239 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LCKP06239 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LCKP06239 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LCKP06239 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LCKP06239 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LCKP06239 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LCKP06239 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LCKP06239 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LCKP06239 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LCKP06239 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LCKP06239 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LCKP06239 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LCKP06239 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LCKP06239 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LCKP06239 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LCKP06239 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LCKP06239 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LCKP06239 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LCKP06239 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LCKP06239 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LCKP06239 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LCKP06239 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms