Protein–RNA interactions for Protein: P02549

SPTA1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1P02549 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPTA1P02549 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPTA1P02549 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPTA1P02549 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPTA1P02549 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPTA1P02549 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPTA1P02549 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPTA1P02549 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPTA1P02549 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPTA1P02549 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPTA1P02549 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPTA1P02549 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPTA1P02549 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPTA1P02549 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SPTA1P02549 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SPTA1P02549 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPTA1P02549 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SPTA1P02549 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SPTA1P02549 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPTA1P02549 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPTA1P02549 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SPTA1P02549 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPTA1P02549 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPTA1P02549 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPTA1P02549 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPTA1P02549 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPTA1P02549 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPTA1P02549 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPTA1P02549 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPTA1P02549 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPTA1P02549 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPTA1P02549 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPTA1P02549 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPTA1P02549 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPTA1P02549 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPTA1P02549 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPTA1P02549 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPTA1P02549 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SPTA1P02549 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SPTA1P02549 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPTA1P02549 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPTA1P02549 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPTA1P02549 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPTA1P02549 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPTA1P02549 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPTA1P02549 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPTA1P02549 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPTA1P02549 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPTA1P02549 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPTA1P02549 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPTA1P02549 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPTA1P02549 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPTA1P02549 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPTA1P02549 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPTA1P02549 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPTA1P02549 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPTA1P02549 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPTA1P02549 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPTA1P02549 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPTA1P02549 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPTA1P02549 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPTA1P02549 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPTA1P02549 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPTA1P02549 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPTA1P02549 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPTA1P02549 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPTA1P02549 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPTA1P02549 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPTA1P02549 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPTA1P02549 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPTA1P02549 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPTA1P02549 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SPTA1P02549 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPTA1P02549 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPTA1P02549 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SPTA1P02549 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SPTA1P02549 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPTA1P02549 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPTA1P02549 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPTA1P02549 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPTA1P02549 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPTA1P02549 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPTA1P02549 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPTA1P02549 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPTA1P02549 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SPTA1P02549 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPTA1P02549 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPTA1P02549 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPTA1P02549 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPTA1P02549 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPTA1P02549 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPTA1P02549 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPTA1P02549 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPTA1P02549 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPTA1P02549 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPTA1P02549 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPTA1P02549 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPTA1P02549 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPTA1P02549 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPTA1P02549 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150.3 ms