Protein–RNA interactions for Protein: P01906

HLA-DQA2, HLA class II histocompatibility antigen, DQ alpha 2 chain, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQA2P01906 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HLA-DQA2P01906 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HLA-DQA2P01906 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HLA-DQA2P01906 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HLA-DQA2P01906 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HLA-DQA2P01906 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-DQA2P01906 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-DQA2P01906 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-DQA2P01906 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HLA-DQA2P01906 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HLA-DQA2P01906 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HLA-DQA2P01906 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HLA-DQA2P01906 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HLA-DQA2P01906 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HLA-DQA2P01906 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HLA-DQA2P01906 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HLA-DQA2P01906 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HLA-DQA2P01906 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HLA-DQA2P01906 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HLA-DQA2P01906 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HLA-DQA2P01906 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HLA-DQA2P01906 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HLA-DQA2P01906 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-DQA2P01906 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-DQA2P01906 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-DQA2P01906 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-DQA2P01906 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HLA-DQA2P01906 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HLA-DQA2P01906 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HLA-DQA2P01906 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HLA-DQA2P01906 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HLA-DQA2P01906 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HLA-DQA2P01906 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HLA-DQA2P01906 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
HLA-DQA2P01906 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HLA-DQA2P01906 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HLA-DQA2P01906 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HLA-DQA2P01906 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HLA-DQA2P01906 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HLA-DQA2P01906 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HLA-DQA2P01906 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HLA-DQA2P01906 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HLA-DQA2P01906 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HLA-DQA2P01906 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HLA-DQA2P01906 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HLA-DQA2P01906 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HLA-DQA2P01906 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HLA-DQA2P01906 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HLA-DQA2P01906 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HLA-DQA2P01906 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HLA-DQA2P01906 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HLA-DQA2P01906 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HLA-DQA2P01906 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HLA-DQA2P01906 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HLA-DQA2P01906 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HLA-DQA2P01906 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HLA-DQA2P01906 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HLA-DQA2P01906 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HLA-DQA2P01906 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HLA-DQA2P01906 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HLA-DQA2P01906 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HLA-DQA2P01906 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HLA-DQA2P01906 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HLA-DQA2P01906 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HLA-DQA2P01906 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HLA-DQA2P01906 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HLA-DQA2P01906 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HLA-DQA2P01906 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HLA-DQA2P01906 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
HLA-DQA2P01906 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HLA-DQA2P01906 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HLA-DQA2P01906 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HLA-DQA2P01906 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HLA-DQA2P01906 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HLA-DQA2P01906 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HLA-DQA2P01906 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HLA-DQA2P01906 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HLA-DQA2P01906 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HLA-DQA2P01906 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HLA-DQA2P01906 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HLA-DQA2P01906 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HLA-DQA2P01906 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HLA-DQA2P01906 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HLA-DQA2P01906 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HLA-DQA2P01906 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HLA-DQA2P01906 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HLA-DQA2P01906 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HLA-DQA2P01906 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HLA-DQA2P01906 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HLA-DQA2P01906 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HLA-DQA2P01906 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HLA-DQA2P01906 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HLA-DQA2P01906 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HLA-DQA2P01906 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HLA-DQA2P01906 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HLA-DQA2P01906 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HLA-DQA2P01906 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HLA-DQA2P01906 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HLA-DQA2P01906 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HLA-DQA2P01906 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.6 ms