Protein–RNA interactions for Protein: P01891

HLA-A, HLA class I histocompatibility antigen, A-68 alpha chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-AP01891 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HLA-AP01891 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HLA-AP01891 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HLA-AP01891 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HLA-AP01891 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HLA-AP01891 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HLA-AP01891 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HLA-AP01891 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HLA-AP01891 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HLA-AP01891 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HLA-AP01891 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HLA-AP01891 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HLA-AP01891 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HLA-AP01891 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HLA-AP01891 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HLA-AP01891 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HLA-AP01891 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HLA-AP01891 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HLA-AP01891 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HLA-AP01891 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLA-AP01891 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLA-AP01891 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLA-AP01891 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLA-AP01891 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLA-AP01891 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLA-AP01891 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLA-AP01891 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HLA-AP01891 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HLA-AP01891 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HLA-AP01891 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HLA-AP01891 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HLA-AP01891 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HLA-AP01891 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HLA-AP01891 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HLA-AP01891 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HLA-AP01891 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HLA-AP01891 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HLA-AP01891 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HLA-AP01891 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HLA-AP01891 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HLA-AP01891 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HLA-AP01891 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HLA-AP01891 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HLA-AP01891 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HLA-AP01891 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HLA-AP01891 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HLA-AP01891 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HLA-AP01891 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HLA-AP01891 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HLA-AP01891 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLA-AP01891 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLA-AP01891 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLA-AP01891 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLA-AP01891 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLA-AP01891 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HLA-AP01891 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HLA-AP01891 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HLA-AP01891 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HLA-AP01891 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HLA-AP01891 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HLA-AP01891 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HLA-AP01891 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HLA-AP01891 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HLA-AP01891 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HLA-AP01891 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HLA-AP01891 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HLA-AP01891 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HLA-AP01891 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HLA-AP01891 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HLA-AP01891 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HLA-AP01891 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HLA-AP01891 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HLA-AP01891 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HLA-AP01891 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HLA-AP01891 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HLA-AP01891 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HLA-AP01891 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HLA-AP01891 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HLA-AP01891 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HLA-AP01891 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HLA-AP01891 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HLA-AP01891 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HLA-AP01891 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HLA-AP01891 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HLA-AP01891 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HLA-AP01891 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HLA-AP01891 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HLA-AP01891 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HLA-AP01891 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HLA-AP01891 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HLA-AP01891 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HLA-AP01891 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HLA-AP01891 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HLA-AP01891 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
HLA-AP01891 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HLA-AP01891 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HLA-AP01891 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HLA-AP01891 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HLA-AP01891 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HLA-AP01891 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms