Protein–RNA interactions for Protein: P01258

CALCA, Calcitonin, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCAP01258 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CALCAP01258 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CALCAP01258 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CALCAP01258 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CALCAP01258 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CALCAP01258 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CALCAP01258 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CALCAP01258 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CALCAP01258 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CALCAP01258 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CALCAP01258 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CALCAP01258 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CALCAP01258 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CALCAP01258 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CALCAP01258 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CALCAP01258 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CALCAP01258 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CALCAP01258 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CALCAP01258 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CALCAP01258 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CALCAP01258 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CALCAP01258 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CALCAP01258 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CALCAP01258 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CALCAP01258 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CALCAP01258 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CALCAP01258 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CALCAP01258 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CALCAP01258 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CALCAP01258 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CALCAP01258 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CALCAP01258 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CALCAP01258 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CALCAP01258 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CALCAP01258 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CALCAP01258 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CALCAP01258 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CALCAP01258 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CALCAP01258 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CALCAP01258 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CALCAP01258 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CALCAP01258 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CALCAP01258 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CALCAP01258 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CALCAP01258 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CALCAP01258 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CALCAP01258 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CALCAP01258 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CALCAP01258 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CALCAP01258 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CALCAP01258 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CALCAP01258 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CALCAP01258 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CALCAP01258 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CALCAP01258 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CALCAP01258 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CALCAP01258 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CALCAP01258 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CALCAP01258 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CALCAP01258 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CALCAP01258 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CALCAP01258 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CALCAP01258 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CALCAP01258 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CALCAP01258 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CALCAP01258 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CALCAP01258 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CALCAP01258 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CALCAP01258 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CALCAP01258 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CALCAP01258 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CALCAP01258 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CALCAP01258 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CALCAP01258 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CALCAP01258 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CALCAP01258 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CALCAP01258 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CALCAP01258 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CALCAP01258 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CALCAP01258 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CALCAP01258 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CALCAP01258 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CALCAP01258 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CALCAP01258 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CALCAP01258 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CALCAP01258 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CALCAP01258 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CALCAP01258 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CALCAP01258 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CALCAP01258 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CALCAP01258 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CALCAP01258 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CALCAP01258 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CALCAP01258 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CALCAP01258 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CALCAP01258 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CALCAP01258 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CALCAP01258 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CALCAP01258 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CALCAP01258 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms