Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
SEC24BO95487 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
SEC24BO95487 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
SEC24BO95487 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
SEC24BO95487 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
SEC24BO95487 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
SEC24BO95487 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
SEC24BO95487 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
SEC24BO95487 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
SEC24BO95487 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
SEC24BO95487 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
SEC24BO95487 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
SEC24BO95487 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
SEC24BO95487 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
SEC24BO95487 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
SEC24BO95487 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
SEC24BO95487 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
SEC24BO95487 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
SEC24BO95487 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
SEC24BO95487 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
SEC24BO95487 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
SEC24BO95487 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC31.28■■■□□ 2.6
SEC24BO95487 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
SEC24BO95487 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
SEC24BO95487 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
SEC24BO95487 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
SEC24BO95487 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
SEC24BO95487 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
SEC24BO95487 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
SEC24BO95487 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
SEC24BO95487 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
SEC24BO95487 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
SEC24BO95487 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
SEC24BO95487 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.6
SEC24BO95487 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
SEC24BO95487 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
SEC24BO95487 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
SEC24BO95487 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
SEC24BO95487 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
SEC24BO95487 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
SEC24BO95487 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
SEC24BO95487 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
SEC24BO95487 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
SEC24BO95487 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
SEC24BO95487 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
SEC24BO95487 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
SEC24BO95487 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
SEC24BO95487 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
SEC24BO95487 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
SEC24BO95487 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
SEC24BO95487 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
SEC24BO95487 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
SEC24BO95487 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
SEC24BO95487 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
SEC24BO95487 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC31.2■■■□□ 2.58
SEC24BO95487 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
SEC24BO95487 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
SEC24BO95487 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
SEC24BO95487 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
SEC24BO95487 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
SEC24BO95487 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
SEC24BO95487 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
SEC24BO95487 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
SEC24BO95487 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
SEC24BO95487 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
SEC24BO95487 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
SEC24BO95487 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
SEC24BO95487 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
SEC24BO95487 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
SEC24BO95487 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
SEC24BO95487 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
SEC24BO95487 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
SEC24BO95487 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
SEC24BO95487 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
SEC24BO95487 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
SEC24BO95487 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
SEC24BO95487 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
SEC24BO95487 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
SEC24BO95487 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
SEC24BO95487 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
SEC24BO95487 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC31.12■■■□□ 2.57
SEC24BO95487 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
SEC24BO95487 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
SEC24BO95487 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
SEC24BO95487 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
SEC24BO95487 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
SEC24BO95487 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
SEC24BO95487 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
SEC24BO95487 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
SEC24BO95487 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
SEC24BO95487 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC31.08■■■□□ 2.57
SEC24BO95487 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
SEC24BO95487 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
SEC24BO95487 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
SEC24BO95487 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
SEC24BO95487 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.06■■■□□ 2.56
SEC24BO95487 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
SEC24BO95487 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
SEC24BO95487 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
SEC24BO95487 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms