Protein–RNA interactions for Protein: O94769

ECM2, Extracellular matrix protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM2O94769 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ECM2O94769 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ECM2O94769 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ECM2O94769 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ECM2O94769 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ECM2O94769 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ECM2O94769 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
ECM2O94769 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ECM2O94769 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ECM2O94769 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ECM2O94769 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ECM2O94769 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ECM2O94769 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ECM2O94769 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ECM2O94769 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ECM2O94769 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ECM2O94769 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ECM2O94769 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ECM2O94769 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ECM2O94769 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ECM2O94769 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ECM2O94769 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ECM2O94769 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ECM2O94769 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ECM2O94769 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ECM2O94769 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ECM2O94769 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ECM2O94769 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ECM2O94769 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ECM2O94769 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ECM2O94769 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ECM2O94769 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ECM2O94769 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ECM2O94769 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
ECM2O94769 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
ECM2O94769 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ECM2O94769 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ECM2O94769 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
ECM2O94769 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ECM2O94769 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ECM2O94769 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ECM2O94769 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ECM2O94769 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ECM2O94769 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ECM2O94769 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
ECM2O94769 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
ECM2O94769 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ECM2O94769 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ECM2O94769 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ECM2O94769 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ECM2O94769 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
ECM2O94769 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ECM2O94769 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
ECM2O94769 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
ECM2O94769 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
ECM2O94769 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ECM2O94769 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ECM2O94769 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
ECM2O94769 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ECM2O94769 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ECM2O94769 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
ECM2O94769 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ECM2O94769 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ECM2O94769 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ECM2O94769 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ECM2O94769 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ECM2O94769 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
ECM2O94769 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
ECM2O94769 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ECM2O94769 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ECM2O94769 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ECM2O94769 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ECM2O94769 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ECM2O94769 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
ECM2O94769 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ECM2O94769 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ECM2O94769 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ECM2O94769 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ECM2O94769 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ECM2O94769 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
ECM2O94769 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ECM2O94769 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ECM2O94769 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ECM2O94769 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ECM2O94769 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ECM2O94769 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ECM2O94769 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ECM2O94769 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ECM2O94769 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ECM2O94769 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ECM2O94769 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ECM2O94769 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ECM2O94769 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ECM2O94769 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ECM2O94769 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ECM2O94769 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
ECM2O94769 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ECM2O94769 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ECM2O94769 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ECM2O94769 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms