Protein–RNA interactions for Protein: O75570

MTRF1, Peptide chain release factor 1, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRF1O75570 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTRF1O75570 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MTRF1O75570 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTRF1O75570 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTRF1O75570 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTRF1O75570 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTRF1O75570 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTRF1O75570 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTRF1O75570 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTRF1O75570 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTRF1O75570 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTRF1O75570 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MTRF1O75570 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTRF1O75570 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTRF1O75570 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTRF1O75570 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTRF1O75570 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTRF1O75570 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTRF1O75570 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTRF1O75570 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTRF1O75570 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTRF1O75570 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTRF1O75570 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MTRF1O75570 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MTRF1O75570 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MTRF1O75570 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MTRF1O75570 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MTRF1O75570 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTRF1O75570 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTRF1O75570 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTRF1O75570 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTRF1O75570 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTRF1O75570 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MTRF1O75570 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTRF1O75570 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MTRF1O75570 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTRF1O75570 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTRF1O75570 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTRF1O75570 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTRF1O75570 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTRF1O75570 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTRF1O75570 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTRF1O75570 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTRF1O75570 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MTRF1O75570 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MTRF1O75570 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MTRF1O75570 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
MTRF1O75570 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
MTRF1O75570 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTRF1O75570 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTRF1O75570 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTRF1O75570 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTRF1O75570 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTRF1O75570 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTRF1O75570 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTRF1O75570 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTRF1O75570 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTRF1O75570 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTRF1O75570 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTRF1O75570 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTRF1O75570 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTRF1O75570 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTRF1O75570 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTRF1O75570 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTRF1O75570 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTRF1O75570 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTRF1O75570 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTRF1O75570 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTRF1O75570 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTRF1O75570 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTRF1O75570 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTRF1O75570 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTRF1O75570 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTRF1O75570 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTRF1O75570 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTRF1O75570 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTRF1O75570 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTRF1O75570 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MTRF1O75570 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTRF1O75570 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTRF1O75570 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTRF1O75570 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTRF1O75570 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTRF1O75570 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTRF1O75570 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTRF1O75570 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTRF1O75570 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTRF1O75570 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTRF1O75570 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTRF1O75570 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTRF1O75570 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTRF1O75570 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTRF1O75570 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTRF1O75570 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTRF1O75570 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTRF1O75570 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTRF1O75570 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTRF1O75570 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTRF1O75570 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTRF1O75570 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms