Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCN2BO60939 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SCN2BO60939 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCN2BO60939 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCN2BO60939 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCN2BO60939 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCN2BO60939 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCN2BO60939 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCN2BO60939 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCN2BO60939 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCN2BO60939 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SCN2BO60939 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCN2BO60939 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCN2BO60939 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCN2BO60939 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCN2BO60939 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCN2BO60939 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCN2BO60939 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SCN2BO60939 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCN2BO60939 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCN2BO60939 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCN2BO60939 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SCN2BO60939 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCN2BO60939 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCN2BO60939 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCN2BO60939 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCN2BO60939 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCN2BO60939 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCN2BO60939 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCN2BO60939 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCN2BO60939 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCN2BO60939 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCN2BO60939 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCN2BO60939 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCN2BO60939 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCN2BO60939 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCN2BO60939 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCN2BO60939 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCN2BO60939 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCN2BO60939 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCN2BO60939 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCN2BO60939 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCN2BO60939 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCN2BO60939 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCN2BO60939 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCN2BO60939 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCN2BO60939 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SCN2BO60939 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCN2BO60939 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCN2BO60939 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCN2BO60939 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SCN2BO60939 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCN2BO60939 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCN2BO60939 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCN2BO60939 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SCN2BO60939 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCN2BO60939 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCN2BO60939 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCN2BO60939 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCN2BO60939 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCN2BO60939 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCN2BO60939 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCN2BO60939 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCN2BO60939 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCN2BO60939 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCN2BO60939 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCN2BO60939 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCN2BO60939 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCN2BO60939 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCN2BO60939 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SCN2BO60939 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SCN2BO60939 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCN2BO60939 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCN2BO60939 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCN2BO60939 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCN2BO60939 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCN2BO60939 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCN2BO60939 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCN2BO60939 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCN2BO60939 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCN2BO60939 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCN2BO60939 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCN2BO60939 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SCN2BO60939 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SCN2BO60939 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCN2BO60939 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCN2BO60939 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCN2BO60939 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCN2BO60939 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCN2BO60939 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCN2BO60939 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCN2BO60939 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCN2BO60939 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCN2BO60939 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCN2BO60939 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCN2BO60939 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SCN2BO60939 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SCN2BO60939 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCN2BO60939 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCN2BO60939 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.7 ms