Protein–RNA interactions for Protein: O60888

CUTA, Protein CutA, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUTAO60888 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CUTAO60888 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CUTAO60888 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CUTAO60888 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CUTAO60888 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CUTAO60888 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CUTAO60888 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CUTAO60888 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CUTAO60888 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CUTAO60888 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CUTAO60888 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CUTAO60888 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CUTAO60888 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
CUTAO60888 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CUTAO60888 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CUTAO60888 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CUTAO60888 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CUTAO60888 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CUTAO60888 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CUTAO60888 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CUTAO60888 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CUTAO60888 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CUTAO60888 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CUTAO60888 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CUTAO60888 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CUTAO60888 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CUTAO60888 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CUTAO60888 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CUTAO60888 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CUTAO60888 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CUTAO60888 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CUTAO60888 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CUTAO60888 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CUTAO60888 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CUTAO60888 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
CUTAO60888 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CUTAO60888 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CUTAO60888 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CUTAO60888 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CUTAO60888 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CUTAO60888 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CUTAO60888 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29■■■□□ 2.23
CUTAO60888 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CUTAO60888 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CUTAO60888 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
CUTAO60888 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CUTAO60888 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CUTAO60888 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CUTAO60888 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CUTAO60888 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CUTAO60888 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CUTAO60888 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CUTAO60888 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CUTAO60888 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CUTAO60888 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CUTAO60888 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CUTAO60888 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CUTAO60888 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CUTAO60888 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CUTAO60888 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CUTAO60888 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CUTAO60888 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CUTAO60888 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CUTAO60888 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CUTAO60888 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CUTAO60888 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CUTAO60888 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CUTAO60888 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
CUTAO60888 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
CUTAO60888 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
CUTAO60888 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CUTAO60888 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CUTAO60888 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CUTAO60888 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CUTAO60888 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CUTAO60888 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CUTAO60888 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CUTAO60888 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CUTAO60888 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CUTAO60888 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CUTAO60888 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CUTAO60888 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CUTAO60888 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CUTAO60888 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CUTAO60888 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CUTAO60888 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CUTAO60888 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CUTAO60888 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CUTAO60888 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CUTAO60888 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CUTAO60888 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CUTAO60888 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CUTAO60888 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CUTAO60888 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CUTAO60888 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CUTAO60888 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CUTAO60888 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CUTAO60888 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CUTAO60888 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CUTAO60888 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms