Protein–RNA interactions for Protein: O60832

DKC1, H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKC1O60832 FARP1-224ENST00000598389 747 ntTSL 56.21□□□□□ -1.422e-7■■■■■ 71.6
DKC1O60832 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.893e-13■■■■■ 71.2
DKC1O60832 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.652e-21■■■■■ 71
DKC1O60832 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.652e-21■■■■■ 71
DKC1O60832 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.792e-21■■■■■ 71
DKC1O60832 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.72e-21■■■■■ 71
DKC1O60832 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.42e-7■■■■■ 70.9
DKC1O60832 LRP5-206ENST00000529993 5103 ntTSL 1 (best)16.44■□□□□ 0.222e-7■■■■■ 70.9
DKC1O60832 ETV5-203ENST00000421809 554 ntTSL 223.27■■□□□ 1.324e-6■■■■■ 70.9
DKC1O60832 ETV5-210ENST00000476890 642 ntTSL 221.62■■□□□ 1.054e-6■■■■■ 70.9
DKC1O60832 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.34e-6■■■■■ 70.9
DKC1O60832 ETV5-204ENST00000422039 564 ntTSL 414.34□□□□□ -0.114e-6■■■■■ 70.9
DKC1O60832 ETV5-201ENST00000306376 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.174e-6■■■■■ 70.9
DKC1O60832 ETV5-207ENST00000440773 574 ntTSL 46.93□□□□□ -1.34e-6■■■■■ 70.9
DKC1O60832 ETV5-202ENST00000413301 573 ntTSL 46.85□□□□□ -1.314e-6■■■■■ 70.9
DKC1O60832 ETV5-208ENST00000472868 238 ntTSL 52.86□□□□□ -1.954e-6■■■■■ 70.9
DKC1O60832 SPSB1-204ENST00000450402 822 ntTSL 517.47■□□□□ 0.399e-16■■■■■ 70.8
DKC1O60832 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.172e-7■■■■■ 70.8
DKC1O60832 AC009119.2-202ENST00000563312 458 ntTSL 215.64■□□□□ 0.099e-16■■■■■ 70.8
DKC1O60832 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.079e-16■■■■■ 70.8
DKC1O60832 MLYCD-201ENST00000262430 13038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.689e-16■■■■■ 70.8
DKC1O60832 VPS13D-212ENST00000543766 3838 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.929e-16■■■■■ 70.8
DKC1O60832 VPS13D-211ENST00000543710 5676 ntTSL 1 (best)8.81□□□□□ -19e-16■■■■■ 70.8
DKC1O60832 VPS13D-201ENST00000011700 10969 ntTSL 1 (best)6.87□□□□□ -1.319e-16■■■■■ 70.8
DKC1O60832 AC009119.2-203ENST00000566309 583 ntTSL 26.07□□□□□ -1.449e-16■■■■■ 70.8
DKC1O60832 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.529e-16■■■■■ 70.8
DKC1O60832 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.549e-16■■■■■ 70.8
DKC1O60832 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.089e-10■■■■■ 70.7
DKC1O60832 ASGR2-201ENST00000254850 1396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.079e-10■■■■■ 70.7
DKC1O60832 ASGR2-202ENST00000355035 1386 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.079e-10■■■■■ 70.7
DKC1O60832 LDLRAD4-212ENST00000587905 743 ntTSL 522.89■■□□□ 1.252e-7■■■■■ 70.6
DKC1O60832 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.022e-7■■■■■ 70.6
DKC1O60832 PTPN4-207ENST00000460162 623 ntTSL 425.57■■□□□ 1.684e-16■■■■■ 70.3
DKC1O60832 PTPN4-202ENST00000420482 568 ntTSL 424.01■■□□□ 1.434e-16■■■■■ 70.3
DKC1O60832 SYNE3-205ENST00000557275 13488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.841e-9■■■■■ 70.1
DKC1O60832 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.254e-7■■■■■ 69.9
DKC1O60832 AGAP1-214ENST00000635100 2478 ntTSL 516.33■□□□□ 0.24e-7■■■■■ 69.9
DKC1O60832 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.044e-7■■■■■ 69.9
DKC1O60832 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.477e-7■■■■■ 69.8
DKC1O60832 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.437e-7■■■■■ 69.8
DKC1O60832 PTPRN2-202ENST00000389416 4692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.067e-7■■■■■ 69.8
DKC1O60832 PTPRN2-203ENST00000389418 4706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.067e-7■■■■■ 69.8
DKC1O60832 BAIAP2-206ENST00000570913 559 ntTSL 417.22■□□□□ 0.354e-7■■■■■ 69.7
DKC1O60832 VWCE-203ENST00000398808 717 ntTSL 317.56■□□□□ 0.42e-8■■■■■ 69.6
DKC1O60832 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.132e-8■■■■■ 69.6
DKC1O60832 MED24-204ENST00000394128 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.275e-23■■■■■ 69.3
DKC1O60832 MED24-214ENST00000535508 3334 ntTSL 213.17□□□□□ -0.35e-23■■■■■ 69.3
DKC1O60832 MED24-201ENST00000356271 3446 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.385e-23■■■■■ 69.3
DKC1O60832 MED24-203ENST00000394127 3456 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.425e-23■■■■■ 69.3
DKC1O60832 MED24-202ENST00000394126 3896 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.65e-23■■■■■ 69.3
DKC1O60832 MED24-234ENST00000614384 454 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.975e-23■■■■■ 69.3
DKC1O60832 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.464e-69■■■■■ 69.3
DKC1O60832 SRGAP2C-202ENST00000367123 7204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.594e-69■■■■■ 69.3
DKC1O60832 FOXN3-212ENST00000556541 388 ntTSL 312.68□□□□□ -0.387e-30■■■■■ 69
DKC1O60832 FOXN3-216ENST00000557496 228 ntTSL 51.14□□□□□ -2.237e-30■■■■■ 69
DKC1O60832 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.086e-7■■■■■ 68.9
DKC1O60832 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.141e-6■■■■■ 68.7
DKC1O60832 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.091e-6■■■■■ 68.7
DKC1O60832 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.011e-6■■■■■ 68.7
DKC1O60832 PRDM16-208ENST00000514189 4236 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.161e-6■■■■■ 68.7
DKC1O60832 PRDM16-207ENST00000512462 3723 ntTSL 1 (best)12.84□□□□□ -0.351e-6■■■■■ 68.7
DKC1O60832 SERGEF-212ENST00000529728 1396 ntTSL 528.23■■■□□ 2.113e-15■■■■■ 68.7
DKC1O60832 SERGEF-214ENST00000530925 793 ntTSL 325.52■■□□□ 1.683e-15■■■■■ 68.7
DKC1O60832 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.573e-15■■■■■ 68.7
DKC1O60832 SERGEF-213ENST00000530613 893 ntTSL 524.66■■□□□ 1.543e-15■■■■■ 68.7
DKC1O60832 SERGEF-207ENST00000527494 1314 ntTSL 524.18■■□□□ 1.463e-15■■■■■ 68.7
DKC1O60832 SERGEF-223ENST00000533328 541 ntTSL 523.72■■□□□ 1.393e-15■■■■■ 68.7
DKC1O60832 SERGEF-218ENST00000532212 622 ntTSL 323.72■■□□□ 1.393e-15■■■■■ 68.7
DKC1O60832 SERGEF-220ENST00000532389 833 ntTSL 523.63■■□□□ 1.373e-15■■■■■ 68.7
DKC1O60832 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.023e-15■■■■■ 68.7
DKC1O60832 SERGEF-205ENST00000525422 1525 ntTSL 1 (best)19.09■□□□□ 0.653e-15■■■■■ 68.7
DKC1O60832 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.123e-15■■■■■ 68.7
DKC1O60832 FOXN2-202ENST00000413569 932 ntTSL 315.47■□□□□ 0.073e-15■■■■■ 68.7
DKC1O60832 TANGO6-210ENST00000568361 622 ntTSL 214.15□□□□□ -0.143e-15■■■■■ 68.7
DKC1O60832 TANGO6-205ENST00000562000 542 ntTSL 413.68□□□□□ -0.223e-15■■■■■ 68.7
DKC1O60832 TANGO6-204ENST00000561931 585 ntTSL 313.14□□□□□ -0.313e-15■■■■■ 68.7
DKC1O60832 TANGO6-201ENST00000261778 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.653e-15■■■■■ 68.7
DKC1O60832 SERGEF-203ENST00000524716 548 ntTSL 410.91□□□□□ -0.663e-15■■■■■ 68.7
DKC1O60832 AC055860.1-201ENST00000525523 688 ntTSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.113e-15■■■■■ 68.7
DKC1O60832 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.423e-15■■■■■ 68.7
DKC1O60832 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.443e-15■■■■■ 68.7
DKC1O60832 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.341e-16■■■■■ 68.3
DKC1O60832 EIF1AX-202ENST00000379607 4427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.691e-16■■■■■ 68.3
DKC1O60832 IPO7-201ENST00000379719 6191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.311e-323■■■■■ 67.8
DKC1O60832 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC3.51□□□□□ -1.851e-323■■■■■ 67.8
DKC1O60832 DIP2C-202ENST00000381496 7749 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.569e-11■■■■■ 67.6
DKC1O60832 PVT1-203ENST00000513868 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.148e-8■■■■■ 67.5
DKC1O60832 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.274e-9■■■■■ 67.4
DKC1O60832 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.074e-9■■■■■ 67.4
DKC1O60832 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.674e-9■■■■■ 67.4
DKC1O60832 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.14e-9■■■■■ 67.4
DKC1O60832 TXNRD2-209ENST00000474308 1854 ntTSL 221.24■□□□□ 0.994e-9■■■■■ 67.4
DKC1O60832 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.824e-9■■■■■ 67.4
DKC1O60832 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.684e-9■■■■■ 67.4
DKC1O60832 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.434e-9■■■■■ 67.4
DKC1O60832 TXNRD2-215ENST00000494454 2004 ntTSL 1 (best)17.32■□□□□ 0.364e-9■■■■■ 67.4
DKC1O60832 TXNRD2-210ENST00000475995 751 ntTSL 517.01■□□□□ 0.314e-9■■■■■ 67.4
DKC1O60832 TXNRD2-221ENST00000635155 858 ntTSL 515.43■□□□□ 0.064e-9■■■■■ 67.4
DKC1O60832 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC1.8□□□□□ -2.123e-48■■■■■ 67.1
DKC1O60832 DKC1-212ENST00000492372 406 ntTSL 29.69□□□□□ -0.861e-323■■■■■ 67.1
Retrieved 100 of 8,567 protein–RNA pairs in 362.2 ms