RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530925.5

SERGEF-214, Transcript of secretion regulating guanine nucleotide exchange factor, humanhuman

TSL 3

Gene SERGEF, Length 793 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERGEF-214ENST00000530925 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.87■■■■■ 6.54
SERGEF-214ENST00000530925 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.86■■■■■ 5.57
SERGEF-214ENST00000530925 ABCC9O60706 1549 aa49.08■■■■■ 5.45
SERGEF-214ENST00000530925 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.07■■■■■ 5.12
SERGEF-214ENST00000530925 NACADO15069 1562 aa46.91■■■■■ 5.1
SERGEF-214ENST00000530925 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.79■■■■■ 5.08
SERGEF-214ENST00000530925 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.49■■■■■ 5.03
SERGEF-214ENST00000530925 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.49■■■■■ 5.03
SERGEF-214ENST00000530925 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.19■■■■■ 4.99
SERGEF-214ENST00000530925 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.07■■■■■ 4.97
SERGEF-214ENST00000530925 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.76■■■■■ 4.92
SERGEF-214ENST00000530925 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.67■■■■■ 4.9
SERGEF-214ENST00000530925 SCRIBQ14160 1630 aa45.49■■■■■ 4.87
SERGEF-214ENST00000530925 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.27■■■■■ 4.84
SERGEF-214ENST00000530925 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.1■■■■■ 4.81
SERGEF-214ENST00000530925 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.48■■■■■ 4.71
SERGEF-214ENST00000530925 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.39■■■■■ 4.7
SERGEF-214ENST00000530925 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.11■■■■■ 4.65
SERGEF-214ENST00000530925 SMARCA4P51532 1647 aa43.46■■■■■ 4.55
SERGEF-214ENST00000530925 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.34■■■■■ 4.53
SERGEF-214ENST00000530925 NCAPD3P42695 1498 aa43.25■■■■■ 4.51
SERGEF-214ENST00000530925 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.25■■■■■ 4.51
SERGEF-214ENST00000530925 SMARCA2P51531 1590 aa43.2■■■■■ 4.51
SERGEF-214ENST00000530925 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.07■■■■■ 4.49
SERGEF-214ENST00000530925 HMGXB3Q12766 1538 aa43.07■■■■■ 4.48
SERGEF-214ENST00000530925 PEG3Q9GZU2 1588 aa43■■■■■ 4.47
SERGEF-214ENST00000530925 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.91■■■■■ 4.46
SERGEF-214ENST00000530925 WIZO95785 1651 aa42.63■■■■■ 4.41
SERGEF-214ENST00000530925 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.43■■■■■ 4.38
SERGEF-214ENST00000530925 NESP48681 1621 aa42.38■■■■■ 4.37
SERGEF-214ENST00000530925 ERCC6Q03468 1493 aa42.32■■■■■ 4.37
SERGEF-214ENST00000530925 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.22■■■■■ 4.35
SERGEF-214ENST00000530925 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.13■■■■■ 4.33
SERGEF-214ENST00000530925 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.98■■■■■ 4.31
SERGEF-214ENST00000530925 CUX2O14529 1486 aa41.97■■■■■ 4.31
SERGEF-214ENST00000530925 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.92■■■■■ 4.3
SERGEF-214ENST00000530925 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.9■■■■■ 4.3
SERGEF-214ENST00000530925 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.83■■■■■ 4.29
SERGEF-214ENST00000530925 CFTRP13569 1480 aa41.68■■■■■ 4.26
SERGEF-214ENST00000530925 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.6■■■■■ 4.25
SERGEF-214ENST00000530925 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.53■■■■■ 4.24
SERGEF-214ENST00000530925 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.53■■■■■ 4.24
SERGEF-214ENST00000530925 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.53■■■■■ 4.24
SERGEF-214ENST00000530925 PRDM2Q13029 1718 aa41.44■■■■■ 4.22
SERGEF-214ENST00000530925 WDR62O43379 1518 aa41.41■■■■■ 4.22
SERGEF-214ENST00000530925 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.15■■■■■ 4.18
SERGEF-214ENST00000530925 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.12■■■■■ 4.17
SERGEF-214ENST00000530925 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41■■■■■ 4.15
SERGEF-214ENST00000530925 TOPBP1Q92547 1522 aa40.85■■■■■ 4.13
SERGEF-214ENST00000530925 ABCC8Q09428 1581 aa40.78■■■■■ 4.12
SERGEF-214ENST00000530925 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.78■■■■■ 4.12
SERGEF-214ENST00000530925 IFT140Q96RY7 1462 aa40.65■■■■■ 4.1
SERGEF-214ENST00000530925 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.52■■■■■ 4.08
SERGEF-214ENST00000530925 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.48■■■■■ 4.07
SERGEF-214ENST00000530925 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.45■■■■■ 4.07
SERGEF-214ENST00000530925 CUX1P39880 1505 aa40.43■■■■■ 4.06
SERGEF-214ENST00000530925 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.39■■■■■ 4.06
SERGEF-214ENST00000530925 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.34■■■■■ 4.05
SERGEF-214ENST00000530925 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.31■■■■■ 4.04
SERGEF-214ENST00000530925 SOGA1O94964 1423 aa40.28■■■■■ 4.04
SERGEF-214ENST00000530925 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.23■■■■■ 4.03
SERGEF-214ENST00000530925 OSCARQ8IYS5 282 aa40.12■■■■■ 4.01
SERGEF-214ENST00000530925 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.1■■■■■ 4.01
SERGEF-214ENST00000530925 WDR97A6NE52 1622 aa40.09■■■■■ 4.01
SERGEF-214ENST00000530925 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.03■■■■■ 4
SERGEF-214ENST00000530925 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.03■■■■■ 4
SERGEF-214ENST00000530925 TOP2BQ02880 1626 aa40■■■■□ 3.99
SERGEF-214ENST00000530925 SYNJ1O43426 1573 aa40■■■■□ 3.99
SERGEF-214ENST00000530925 CHD1O14646 1710 aa39.96■■■■□ 3.99
SERGEF-214ENST00000530925 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.91■■■■□ 3.98
SERGEF-214ENST00000530925 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.88■■■■□ 3.97
SERGEF-214ENST00000530925 GRIN2BQ13224 1484 aa39.86■■■■□ 3.97
SERGEF-214ENST00000530925 PBRM1Q86U86 1689 aa39.84■■■■□ 3.97
SERGEF-214ENST00000530925 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.83■■■■□ 3.97
SERGEF-214ENST00000530925 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.82■■■■□ 3.97
SERGEF-214ENST00000530925 FBLN2P98095 1184 aa39.8■■■■□ 3.96
SERGEF-214ENST00000530925 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.79■■■■□ 3.96
SERGEF-214ENST00000530925 SYNJ2O15056 1496 aa39.64■■■■□ 3.94
SERGEF-214ENST00000530925 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.62■■■■□ 3.93
SERGEF-214ENST00000530925 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.62■■■■□ 3.93
SERGEF-214ENST00000530925 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.62■■■■□ 3.93
SERGEF-214ENST00000530925 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.62■■■■□ 3.93
SERGEF-214ENST00000530925 TRIM41Q8WV44 630 aa39.57■■■■□ 3.93
SERGEF-214ENST00000530925 ARHGEF11O15085 1522 aa39.55■■■■□ 3.92
SERGEF-214ENST00000530925 ADAMTS12P58397 1594 aa39.48■■■■□ 3.91
SERGEF-214ENST00000530925 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.47■■■■□ 3.91
SERGEF-214ENST00000530925 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.44■■■■□ 3.9
SERGEF-214ENST00000530925 GRIN2AQ12879 1464 aa39.37■■■■□ 3.89
SERGEF-214ENST00000530925 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.34■■■■□ 3.89
SERGEF-214ENST00000530925 ARAP1Q96P48 1450 aa39.21■■■■□ 3.87
SERGEF-214ENST00000530925 KIF27Q86VH2 1401 aa39.21■■■■□ 3.87
SERGEF-214ENST00000530925 CEP170Q5SW79 1584 aa39.21■■■■□ 3.87
SERGEF-214ENST00000530925 NUP160Q12769 1436 aa39.18■■■■□ 3.86
SERGEF-214ENST00000530925 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.15■■■■□ 3.86
SERGEF-214ENST00000530925 CUL7Q14999 1698 aa39.06■■■■□ 3.84
SERGEF-214ENST00000530925 IGF1RP08069 1367 aa39.06■■■■□ 3.84
SERGEF-214ENST00000530925 SHROOM2Q13796 1616 aa38.96■■■■□ 3.83
SERGEF-214ENST00000530925 ERCC6L2Q5T890 1561 aa38.92■■■■□ 3.82
SERGEF-214ENST00000530925 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.91■■■■□ 3.82
SERGEF-214ENST00000530925 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa38.83■■■■□ 3.81
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