RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529728.5

SERGEF-212, Transcript of secretion regulating guanine nucleotide exchange factor, humanhuman

TSL 5

Gene SERGEF, Length 1,396 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERGEF-212ENST00000529728 NISCHQ9Y2I1 1504 aa61.72■■■■■ 7.47
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SERGEF-212ENST00000529728 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa51.74■■■■■ 5.87
SERGEF-212ENST00000529728 NACADO15069 1562 aa51.69■■■■■ 5.87
SERGEF-212ENST00000529728 MYO15BQ96JP2 1530 aa51.42■■■■■ 5.82
SERGEF-212ENST00000529728 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP51.42■■■■■ 5.82
SERGEF-212ENST00000529728 DCAF8L2P0C7V8 631 aa51.27■■■■■ 5.8
SERGEF-212ENST00000529728 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa51.14■■■■■ 5.78
SERGEF-212ENST00000529728 UNC13AQ9UPW8 1703 aa50.73■■■■■ 5.71
SERGEF-212ENST00000529728 BICRAQ9NZM4 1560 aa50.26■■■■■ 5.64
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SERGEF-212ENST00000529728 SCRIBQ14160 1630 aa50.04■■■■■ 5.6
SERGEF-212ENST00000529728 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa49.73■■■■■ 5.55
SERGEF-212ENST00000529728 DNAJC5BQ9UF47 199 aa49.45■■■■■ 5.51
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SERGEF-212ENST00000529728 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa48.71■■■■■ 5.39
SERGEF-212ENST00000529728 CECR2Q9BXF3 1484 aa48.32■■■■■ 5.33
SERGEF-212ENST00000529728 SMARCA4P51532 1647 aa47.94■■■■■ 5.26
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SERGEF-212ENST00000529728 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa47.67■■■■■ 5.22
SERGEF-212ENST00000529728 SMARCA2P51531 1590 aa47.61■■■■■ 5.21
SERGEF-212ENST00000529728 PEG3Q9GZU2 1588 aa47.55■■■■■ 5.2
SERGEF-212ENST00000529728 MROH2BQ7Z745 1585 aa47.54■■■■■ 5.2
SERGEF-212ENST00000529728 HMGXB3Q12766 1538 aa47.48■■■■■ 5.19
SERGEF-212ENST00000529728 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP47.21■■■■■ 5.15
SERGEF-212ENST00000529728 WIZO95785 1651 aa47.04■■■■■ 5.12
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SERGEF-212ENST00000529728 NESP48681 1621 aa46.51■■■■■ 5.04
SERGEF-212ENST00000529728 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa46.46■■■■■ 5.03
SERGEF-212ENST00000529728 ERCC6Q03468 1493 aa46.28■■■■■ 5
SERGEF-212ENST00000529728 CADPSQ9ULU8 1353 aa46.22■■■■■ 4.99
SERGEF-212ENST00000529728 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa46.06■■■■■ 4.96
SERGEF-212ENST00000529728 PDS5BQ9NTI5 1447 aa46.05■■■■■ 4.96
SERGEF-212ENST00000529728 CFTRP13569 1480 aa45.98■■■■■ 4.95
SERGEF-212ENST00000529728 CUX2O14529 1486 aa45.97■■■■■ 4.95
SERGEF-212ENST00000529728 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP45.95■■■■■ 4.95
SERGEF-212ENST00000529728 CCDC88BA6NC98 1476 aa45.94■■■■■ 4.95
SERGEF-212ENST00000529728 PRDM2Q13029 1718 aa45.78■■■■■ 4.92
SERGEF-212ENST00000529728 FANCD2Q9BXW9 1451 aa45.69■■■■■ 4.9
SERGEF-212ENST00000529728 CEP164Q9UPV0 1460 aa45.64■■■■■ 4.9
SERGEF-212ENST00000529728 MRC2Q9UBG0 1479 aa45.62■■■■■ 4.89
SERGEF-212ENST00000529728 WDR62O43379 1518 aa45.55■■■■■ 4.88
SERGEF-212ENST00000529728 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP45.42■■■■■ 4.86
SERGEF-212ENST00000529728 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP45.28■■■■■ 4.84
SERGEF-212ENST00000529728 TOPBP1Q92547 1522 aa44.98■■■■■ 4.79
SERGEF-212ENST00000529728 ABCC8Q09428 1581 aa44.96■■■■■ 4.79
SERGEF-212ENST00000529728 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44.94■■■■■ 4.78
SERGEF-212ENST00000529728 IFT140Q96RY7 1462 aa44.7■■■■■ 4.75
SERGEF-212ENST00000529728 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.61■■■■■ 4.73
SERGEF-212ENST00000529728 CUX1P39880 1505 aa44.61■■■■■ 4.73
SERGEF-212ENST00000529728 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP44.6■■■■■ 4.73
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SERGEF-212ENST00000529728 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP44.52■■■■■ 4.72
SERGEF-212ENST00000529728 FGD5Q6ZNL6 1462 aa44.44■■■■■ 4.7
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SERGEF-212ENST00000529728 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa44.35■■■■■ 4.69
SERGEF-212ENST00000529728 SOGA1O94964 1423 aa44.33■■■■■ 4.69
SERGEF-212ENST00000529728 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa44.27■■■■■ 4.68
SERGEF-212ENST00000529728 WDR97A6NE52 1622 aa44.24■■■■■ 4.67
SERGEF-212ENST00000529728 TOP2BQ02880 1626 aa44.24■■■■■ 4.67
SERGEF-212ENST00000529728 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP44.21■■■■■ 4.67
SERGEF-212ENST00000529728 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP44.21■■■■■ 4.67
SERGEF-212ENST00000529728 SYNJ1O43426 1573 aa44.2■■■■■ 4.67
SERGEF-212ENST00000529728 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP44.07■■■■■ 4.64
SERGEF-212ENST00000529728 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa44.05■■■■■ 4.64
SERGEF-212ENST00000529728 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43.94■■■■■ 4.63
SERGEF-212ENST00000529728 OSCARQ8IYS5 282 aa43.91■■■■■ 4.62
SERGEF-212ENST00000529728 CHD1O14646 1710 aa43.88■■■■■ 4.62
SERGEF-212ENST00000529728 PBRM1Q86U86 1689 aa43.88■■■■■ 4.62
SERGEF-212ENST00000529728 GRIN2BQ13224 1484 aa43.87■■■■■ 4.61
SERGEF-212ENST00000529728 GAPVD1Q14C86 1478 aa43.85■■■■■ 4.61
SERGEF-212ENST00000529728 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa43.81■■■■■ 4.6
SERGEF-212ENST00000529728 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP43.8■■■■■ 4.6
SERGEF-212ENST00000529728 SYNJ2O15056 1496 aa43.62■■■■■ 4.57
SERGEF-212ENST00000529728 ERICH3Q5RHP9 1530 aa43.53■■■■■ 4.56
SERGEF-212ENST00000529728 FBLN2P98095 1184 aa43.53■■■■■ 4.56
SERGEF-212ENST00000529728 ADAMTS12P58397 1594 aa43.49■■■■■ 4.55
SERGEF-212ENST00000529728 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP43.46■■■■■ 4.55
SERGEF-212ENST00000529728 CLASP1Q7Z460 1538 aa43.41■■■■■ 4.54
SERGEF-212ENST00000529728 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa43.36■■■■■ 4.53
SERGEF-212ENST00000529728 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa43.36■■■■■ 4.53
SERGEF-212ENST00000529728 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa43.36■■■■■ 4.53
SERGEF-212ENST00000529728 FHAD1B1AJZ9 1412 aa43.34■■■■■ 4.53
SERGEF-212ENST00000529728 GRIN2AQ12879 1464 aa43.32■■■■■ 4.53
SERGEF-212ENST00000529728 ARHGEF11O15085 1522 aa43.31■■■■■ 4.52
SERGEF-212ENST00000529728 KIF27Q86VH2 1401 aa43.28■■■■■ 4.52
SERGEF-212ENST00000529728 NUP160Q12769 1436 aa43.18■■■■■ 4.5
SERGEF-212ENST00000529728 IGF1RP08069 1367 aa43.16■■■■■ 4.5
SERGEF-212ENST00000529728 CEP170Q5SW79 1584 aa43.15■■■■■ 4.5
SERGEF-212ENST00000529728 CUL7Q14999 1698 aa43.13■■■■■ 4.5
SERGEF-212ENST00000529728 ARAP1Q96P48 1450 aa42.96■■■■■ 4.47
SERGEF-212ENST00000529728 TRIM41Q8WV44 630 aa42.94■■■■■ 4.46
SERGEF-212ENST00000529728 SHROOM2Q13796 1616 aa42.94■■■■■ 4.46
SERGEF-212ENST00000529728 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.89■■■■■ 4.46
SERGEF-212ENST00000529728 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa42.85■■■■■ 4.45
SERGEF-212ENST00000529728 CYB5RLQ6IPT4 315 aa42.76■■■■■ 4.44
SERGEF-212ENST00000529728 ERCC6L2Q5T890 1561 aa42.75■■■■■ 4.43
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