Protein–RNA interactions for Protein: O60636

TSPAN2, Tetraspanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN2O60636 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSPAN2O60636 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSPAN2O60636 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSPAN2O60636 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSPAN2O60636 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSPAN2O60636 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSPAN2O60636 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSPAN2O60636 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSPAN2O60636 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSPAN2O60636 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSPAN2O60636 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSPAN2O60636 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSPAN2O60636 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSPAN2O60636 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TSPAN2O60636 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TSPAN2O60636 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TSPAN2O60636 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TSPAN2O60636 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TSPAN2O60636 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSPAN2O60636 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSPAN2O60636 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSPAN2O60636 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSPAN2O60636 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSPAN2O60636 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSPAN2O60636 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TSPAN2O60636 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSPAN2O60636 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSPAN2O60636 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSPAN2O60636 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSPAN2O60636 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSPAN2O60636 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSPAN2O60636 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TSPAN2O60636 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSPAN2O60636 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSPAN2O60636 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSPAN2O60636 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TSPAN2O60636 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TSPAN2O60636 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSPAN2O60636 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSPAN2O60636 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSPAN2O60636 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSPAN2O60636 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSPAN2O60636 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSPAN2O60636 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSPAN2O60636 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSPAN2O60636 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSPAN2O60636 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSPAN2O60636 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSPAN2O60636 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSPAN2O60636 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSPAN2O60636 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSPAN2O60636 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSPAN2O60636 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSPAN2O60636 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSPAN2O60636 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TSPAN2O60636 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TSPAN2O60636 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TSPAN2O60636 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSPAN2O60636 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSPAN2O60636 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSPAN2O60636 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSPAN2O60636 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSPAN2O60636 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSPAN2O60636 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSPAN2O60636 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSPAN2O60636 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSPAN2O60636 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSPAN2O60636 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSPAN2O60636 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSPAN2O60636 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSPAN2O60636 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSPAN2O60636 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TSPAN2O60636 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSPAN2O60636 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSPAN2O60636 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSPAN2O60636 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSPAN2O60636 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSPAN2O60636 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSPAN2O60636 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TSPAN2O60636 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TSPAN2O60636 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TSPAN2O60636 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TSPAN2O60636 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TSPAN2O60636 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TSPAN2O60636 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TSPAN2O60636 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TSPAN2O60636 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TSPAN2O60636 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSPAN2O60636 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSPAN2O60636 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSPAN2O60636 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSPAN2O60636 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSPAN2O60636 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSPAN2O60636 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TSPAN2O60636 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSPAN2O60636 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSPAN2O60636 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSPAN2O60636 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSPAN2O60636 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSPAN2O60636 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms