Protein–RNA interactions for Protein: O60279

SUSD5, Sushi domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD5O60279 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SUSD5O60279 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SUSD5O60279 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SUSD5O60279 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SUSD5O60279 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SUSD5O60279 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SUSD5O60279 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SUSD5O60279 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SUSD5O60279 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SUSD5O60279 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SUSD5O60279 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SUSD5O60279 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SUSD5O60279 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SUSD5O60279 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SUSD5O60279 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SUSD5O60279 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SUSD5O60279 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SUSD5O60279 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SUSD5O60279 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SUSD5O60279 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SUSD5O60279 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SUSD5O60279 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SUSD5O60279 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SUSD5O60279 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SUSD5O60279 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SUSD5O60279 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SUSD5O60279 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SUSD5O60279 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SUSD5O60279 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SUSD5O60279 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SUSD5O60279 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SUSD5O60279 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SUSD5O60279 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SUSD5O60279 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SUSD5O60279 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SUSD5O60279 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SUSD5O60279 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SUSD5O60279 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SUSD5O60279 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SUSD5O60279 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SUSD5O60279 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SUSD5O60279 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SUSD5O60279 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SUSD5O60279 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SUSD5O60279 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SUSD5O60279 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SUSD5O60279 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SUSD5O60279 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SUSD5O60279 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SUSD5O60279 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SUSD5O60279 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SUSD5O60279 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SUSD5O60279 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SUSD5O60279 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SUSD5O60279 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SUSD5O60279 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SUSD5O60279 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SUSD5O60279 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SUSD5O60279 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SUSD5O60279 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SUSD5O60279 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SUSD5O60279 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SUSD5O60279 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SUSD5O60279 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SUSD5O60279 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SUSD5O60279 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SUSD5O60279 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SUSD5O60279 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SUSD5O60279 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SUSD5O60279 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SUSD5O60279 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SUSD5O60279 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SUSD5O60279 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SUSD5O60279 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SUSD5O60279 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SUSD5O60279 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SUSD5O60279 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SUSD5O60279 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SUSD5O60279 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SUSD5O60279 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SUSD5O60279 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SUSD5O60279 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUSD5O60279 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUSD5O60279 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUSD5O60279 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUSD5O60279 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUSD5O60279 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUSD5O60279 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SUSD5O60279 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SUSD5O60279 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SUSD5O60279 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SUSD5O60279 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SUSD5O60279 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SUSD5O60279 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SUSD5O60279 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SUSD5O60279 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SUSD5O60279 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SUSD5O60279 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SUSD5O60279 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SUSD5O60279 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms