Protein–RNA interactions for Protein: O60279

SUSD5, Sushi domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD5O60279 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SUSD5O60279 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SUSD5O60279 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SUSD5O60279 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SUSD5O60279 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SUSD5O60279 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SUSD5O60279 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SUSD5O60279 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SUSD5O60279 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SUSD5O60279 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SUSD5O60279 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SUSD5O60279 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SUSD5O60279 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SUSD5O60279 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SUSD5O60279 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SUSD5O60279 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SUSD5O60279 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SUSD5O60279 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SUSD5O60279 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SUSD5O60279 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SUSD5O60279 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SUSD5O60279 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SUSD5O60279 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SUSD5O60279 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SUSD5O60279 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SUSD5O60279 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SUSD5O60279 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SUSD5O60279 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SUSD5O60279 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SUSD5O60279 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SUSD5O60279 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SUSD5O60279 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SUSD5O60279 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SUSD5O60279 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SUSD5O60279 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SUSD5O60279 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SUSD5O60279 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SUSD5O60279 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SUSD5O60279 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SUSD5O60279 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SUSD5O60279 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SUSD5O60279 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SUSD5O60279 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SUSD5O60279 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SUSD5O60279 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SUSD5O60279 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SUSD5O60279 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SUSD5O60279 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SUSD5O60279 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SUSD5O60279 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SUSD5O60279 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SUSD5O60279 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SUSD5O60279 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SUSD5O60279 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SUSD5O60279 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SUSD5O60279 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SUSD5O60279 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SUSD5O60279 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SUSD5O60279 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SUSD5O60279 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SUSD5O60279 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SUSD5O60279 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SUSD5O60279 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SUSD5O60279 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SUSD5O60279 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SUSD5O60279 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SUSD5O60279 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SUSD5O60279 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SUSD5O60279 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SUSD5O60279 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SUSD5O60279 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SUSD5O60279 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SUSD5O60279 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SUSD5O60279 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SUSD5O60279 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SUSD5O60279 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SUSD5O60279 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SUSD5O60279 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SUSD5O60279 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SUSD5O60279 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SUSD5O60279 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SUSD5O60279 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUSD5O60279 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUSD5O60279 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUSD5O60279 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUSD5O60279 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUSD5O60279 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUSD5O60279 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SUSD5O60279 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SUSD5O60279 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SUSD5O60279 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SUSD5O60279 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SUSD5O60279 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SUSD5O60279 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SUSD5O60279 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SUSD5O60279 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SUSD5O60279 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SUSD5O60279 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SUSD5O60279 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SUSD5O60279 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms