Protein–RNA interactions for Protein: O43464

HTRA2, Serine protease HTRA2, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA2O43464 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HTRA2O43464 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HTRA2O43464 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HTRA2O43464 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HTRA2O43464 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HTRA2O43464 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HTRA2O43464 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HTRA2O43464 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
HTRA2O43464 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HTRA2O43464 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HTRA2O43464 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HTRA2O43464 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HTRA2O43464 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HTRA2O43464 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
HTRA2O43464 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
HTRA2O43464 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
HTRA2O43464 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HTRA2O43464 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HTRA2O43464 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HTRA2O43464 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HTRA2O43464 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HTRA2O43464 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HTRA2O43464 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HTRA2O43464 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HTRA2O43464 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HTRA2O43464 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HTRA2O43464 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HTRA2O43464 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
HTRA2O43464 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HTRA2O43464 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HTRA2O43464 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HTRA2O43464 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HTRA2O43464 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HTRA2O43464 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HTRA2O43464 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HTRA2O43464 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HTRA2O43464 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HTRA2O43464 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HTRA2O43464 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HTRA2O43464 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
HTRA2O43464 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HTRA2O43464 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
HTRA2O43464 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
HTRA2O43464 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
HTRA2O43464 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
HTRA2O43464 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
HTRA2O43464 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
HTRA2O43464 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
HTRA2O43464 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
HTRA2O43464 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
HTRA2O43464 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HTRA2O43464 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HTRA2O43464 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HTRA2O43464 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HTRA2O43464 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HTRA2O43464 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HTRA2O43464 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HTRA2O43464 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HTRA2O43464 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HTRA2O43464 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
HTRA2O43464 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
HTRA2O43464 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HTRA2O43464 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HTRA2O43464 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HTRA2O43464 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HTRA2O43464 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HTRA2O43464 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HTRA2O43464 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HTRA2O43464 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HTRA2O43464 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HTRA2O43464 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HTRA2O43464 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HTRA2O43464 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HTRA2O43464 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HTRA2O43464 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HTRA2O43464 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HTRA2O43464 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HTRA2O43464 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
HTRA2O43464 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HTRA2O43464 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HTRA2O43464 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HTRA2O43464 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HTRA2O43464 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HTRA2O43464 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HTRA2O43464 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
HTRA2O43464 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
HTRA2O43464 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
HTRA2O43464 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
HTRA2O43464 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HTRA2O43464 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HTRA2O43464 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HTRA2O43464 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HTRA2O43464 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HTRA2O43464 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HTRA2O43464 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HTRA2O43464 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HTRA2O43464 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HTRA2O43464 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HTRA2O43464 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HTRA2O43464 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 184.2 ms