Protein–RNA interactions for Protein: O43424

GRID2, Glutamate receptor ionotropic, delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRID2O43424 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GRID2O43424 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GRID2O43424 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GRID2O43424 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GRID2O43424 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GRID2O43424 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GRID2O43424 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GRID2O43424 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GRID2O43424 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GRID2O43424 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GRID2O43424 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GRID2O43424 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GRID2O43424 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GRID2O43424 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GRID2O43424 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GRID2O43424 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GRID2O43424 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GRID2O43424 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GRID2O43424 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GRID2O43424 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
GRID2O43424 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GRID2O43424 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GRID2O43424 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRID2O43424 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRID2O43424 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRID2O43424 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GRID2O43424 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GRID2O43424 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GRID2O43424 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GRID2O43424 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
GRID2O43424 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GRID2O43424 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GRID2O43424 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GRID2O43424 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GRID2O43424 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GRID2O43424 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GRID2O43424 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
GRID2O43424 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GRID2O43424 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GRID2O43424 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GRID2O43424 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GRID2O43424 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GRID2O43424 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GRID2O43424 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GRID2O43424 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GRID2O43424 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GRID2O43424 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GRID2O43424 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GRID2O43424 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GRID2O43424 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GRID2O43424 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
GRID2O43424 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GRID2O43424 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
GRID2O43424 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRID2O43424 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRID2O43424 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
GRID2O43424 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GRID2O43424 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GRID2O43424 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GRID2O43424 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GRID2O43424 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GRID2O43424 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GRID2O43424 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GRID2O43424 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GRID2O43424 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
GRID2O43424 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
GRID2O43424 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
GRID2O43424 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GRID2O43424 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GRID2O43424 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRID2O43424 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRID2O43424 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRID2O43424 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GRID2O43424 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GRID2O43424 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GRID2O43424 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GRID2O43424 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GRID2O43424 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GRID2O43424 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRID2O43424 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRID2O43424 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRID2O43424 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRID2O43424 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRID2O43424 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRID2O43424 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRID2O43424 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRID2O43424 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GRID2O43424 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRID2O43424 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRID2O43424 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRID2O43424 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRID2O43424 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRID2O43424 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRID2O43424 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRID2O43424 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GRID2O43424 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GRID2O43424 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
GRID2O43424 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GRID2O43424 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRID2O43424 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms