Protein–RNA interactions for Protein: O43374

RASA4, Ras GTPase-activating protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASA4O43374 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RASA4O43374 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RASA4O43374 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
RASA4O43374 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RASA4O43374 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RASA4O43374 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
RASA4O43374 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RASA4O43374 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RASA4O43374 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
RASA4O43374 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RASA4O43374 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RASA4O43374 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RASA4O43374 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RASA4O43374 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RASA4O43374 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RASA4O43374 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RASA4O43374 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RASA4O43374 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RASA4O43374 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RASA4O43374 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RASA4O43374 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RASA4O43374 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RASA4O43374 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RASA4O43374 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RASA4O43374 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RASA4O43374 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RASA4O43374 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RASA4O43374 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RASA4O43374 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RASA4O43374 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RASA4O43374 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RASA4O43374 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RASA4O43374 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RASA4O43374 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RASA4O43374 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RASA4O43374 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RASA4O43374 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RASA4O43374 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RASA4O43374 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RASA4O43374 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RASA4O43374 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RASA4O43374 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RASA4O43374 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RASA4O43374 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RASA4O43374 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RASA4O43374 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RASA4O43374 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RASA4O43374 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
RASA4O43374 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RASA4O43374 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
RASA4O43374 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RASA4O43374 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RASA4O43374 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RASA4O43374 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RASA4O43374 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RASA4O43374 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RASA4O43374 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RASA4O43374 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RASA4O43374 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RASA4O43374 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RASA4O43374 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RASA4O43374 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RASA4O43374 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
RASA4O43374 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RASA4O43374 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RASA4O43374 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RASA4O43374 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
RASA4O43374 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RASA4O43374 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RASA4O43374 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RASA4O43374 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
RASA4O43374 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RASA4O43374 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RASA4O43374 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RASA4O43374 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RASA4O43374 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RASA4O43374 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RASA4O43374 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RASA4O43374 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RASA4O43374 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RASA4O43374 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RASA4O43374 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RASA4O43374 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RASA4O43374 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
RASA4O43374 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RASA4O43374 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RASA4O43374 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RASA4O43374 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
RASA4O43374 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RASA4O43374 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RASA4O43374 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RASA4O43374 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RASA4O43374 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RASA4O43374 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RASA4O43374 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RASA4O43374 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RASA4O43374 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RASA4O43374 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RASA4O43374 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RASA4O43374 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms