Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MTSS1O43312 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MTSS1O43312 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MTSS1O43312 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MTSS1O43312 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MTSS1O43312 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MTSS1O43312 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MTSS1O43312 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MTSS1O43312 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MTSS1O43312 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
MTSS1O43312 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MTSS1O43312 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
MTSS1O43312 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MTSS1O43312 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MTSS1O43312 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MTSS1O43312 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MTSS1O43312 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MTSS1O43312 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MTSS1O43312 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
MTSS1O43312 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MTSS1O43312 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MTSS1O43312 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MTSS1O43312 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MTSS1O43312 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MTSS1O43312 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MTSS1O43312 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MTSS1O43312 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MTSS1O43312 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MTSS1O43312 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MTSS1O43312 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
MTSS1O43312 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MTSS1O43312 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MTSS1O43312 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MTSS1O43312 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MTSS1O43312 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MTSS1O43312 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MTSS1O43312 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MTSS1O43312 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MTSS1O43312 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MTSS1O43312 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MTSS1O43312 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MTSS1O43312 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MTSS1O43312 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MTSS1O43312 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MTSS1O43312 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MTSS1O43312 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MTSS1O43312 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MTSS1O43312 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MTSS1O43312 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MTSS1O43312 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MTSS1O43312 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MTSS1O43312 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
MTSS1O43312 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MTSS1O43312 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MTSS1O43312 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MTSS1O43312 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MTSS1O43312 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MTSS1O43312 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MTSS1O43312 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MTSS1O43312 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MTSS1O43312 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MTSS1O43312 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MTSS1O43312 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MTSS1O43312 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MTSS1O43312 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
MTSS1O43312 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MTSS1O43312 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MTSS1O43312 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MTSS1O43312 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
MTSS1O43312 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MTSS1O43312 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MTSS1O43312 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MTSS1O43312 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MTSS1O43312 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MTSS1O43312 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MTSS1O43312 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MTSS1O43312 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MTSS1O43312 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MTSS1O43312 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MTSS1O43312 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
MTSS1O43312 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MTSS1O43312 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MTSS1O43312 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MTSS1O43312 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MTSS1O43312 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MTSS1O43312 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MTSS1O43312 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MTSS1O43312 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MTSS1O43312 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MTSS1O43312 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MTSS1O43312 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
MTSS1O43312 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MTSS1O43312 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MTSS1O43312 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MTSS1O43312 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MTSS1O43312 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MTSS1O43312 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26■■□□□ 1.75
MTSS1O43312 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MTSS1O43312 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MTSS1O43312 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms