Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
FANCAO15360 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.98
FANCAO15360 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC39.88■■■■□ 3.98
FANCAO15360 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC39.88■■■■□ 3.98
FANCAO15360 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.98
FANCAO15360 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.98
FANCAO15360 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
FANCAO15360 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC39.87■■■■□ 3.97
FANCAO15360 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC39.87■■■■□ 3.97
FANCAO15360 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC39.87■■■■□ 3.97
FANCAO15360 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC39.87■■■■□ 3.97
FANCAO15360 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
FANCAO15360 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC39.86■■■■□ 3.97
FANCAO15360 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC39.86■■■■□ 3.97
FANCAO15360 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
FANCAO15360 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC39.85■■■■□ 3.97
FANCAO15360 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
FANCAO15360 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC39.84■■■■□ 3.97
FANCAO15360 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC39.84■■■■□ 3.97
FANCAO15360 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.84■■■■□ 3.97
FANCAO15360 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
FANCAO15360 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
FANCAO15360 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
FANCAO15360 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.82■■■■□ 3.97
FANCAO15360 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
FANCAO15360 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC39.81■■■■□ 3.96
FANCAO15360 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC39.81■■■■□ 3.96
FANCAO15360 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC39.79■■■■□ 3.96
FANCAO15360 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC39.79■■■■□ 3.96
FANCAO15360 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
FANCAO15360 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC39.78■■■■□ 3.96
FANCAO15360 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
FANCAO15360 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
FANCAO15360 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
FANCAO15360 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
FANCAO15360 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
FANCAO15360 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
FANCAO15360 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
FANCAO15360 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC39.75■■■■□ 3.95
FANCAO15360 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC39.75■■■■□ 3.95
FANCAO15360 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC39.74■■■■□ 3.95
FANCAO15360 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC39.73■■■■□ 3.95
FANCAO15360 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC39.72■■■■□ 3.95
FANCAO15360 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.7■■■■□ 3.95
FANCAO15360 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
FANCAO15360 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.7■■■■□ 3.95
FANCAO15360 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
FANCAO15360 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC39.69■■■■□ 3.94
FANCAO15360 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC39.68■■■■□ 3.94
FANCAO15360 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
FANCAO15360 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
FANCAO15360 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
FANCAO15360 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
FANCAO15360 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC39.68■■■■□ 3.94
FANCAO15360 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.67■■■■□ 3.94
FANCAO15360 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC39.66■■■■□ 3.94
FANCAO15360 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC39.65■■■■□ 3.94
FANCAO15360 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC39.64■■■■□ 3.94
FANCAO15360 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.63■■■■□ 3.94
FANCAO15360 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.62■■■■□ 3.93
FANCAO15360 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
FANCAO15360 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC39.62■■■■□ 3.93
FANCAO15360 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC39.62■■■■□ 3.93
FANCAO15360 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
FANCAO15360 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC39.61■■■■□ 3.93
FANCAO15360 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
FANCAO15360 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
FANCAO15360 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.59■■■■□ 3.93
FANCAO15360 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
FANCAO15360 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC39.59■■■■□ 3.93
FANCAO15360 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
FANCAO15360 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC39.58■■■■□ 3.93
FANCAO15360 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
FANCAO15360 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC39.57■■■■□ 3.93
FANCAO15360 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC39.56■■■■□ 3.92
FANCAO15360 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
FANCAO15360 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
FANCAO15360 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
FANCAO15360 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC39.55■■■■□ 3.92
FANCAO15360 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC39.55■■■■□ 3.92
FANCAO15360 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
FANCAO15360 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC39.54■■■■□ 3.92
FANCAO15360 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC39.53■■■■□ 3.92
FANCAO15360 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC39.51■■■■□ 3.92
FANCAO15360 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC39.51■■■■□ 3.92
FANCAO15360 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.51■■■■□ 3.92
FANCAO15360 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC39.51■■■■□ 3.92
FANCAO15360 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
FANCAO15360 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
FANCAO15360 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
FANCAO15360 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC39.49■■■■□ 3.91
FANCAO15360 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC39.49■■■■□ 3.91
FANCAO15360 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
FANCAO15360 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
FANCAO15360 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
FANCAO15360 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
FANCAO15360 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
FANCAO15360 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
FANCAO15360 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC39.46■■■■□ 3.91
FANCAO15360 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms