Protein–RNA interactions for Protein: O14657

TOR1B, Torsin-1B, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOR1BO14657 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TOR1BO14657 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TOR1BO14657 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TOR1BO14657 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TOR1BO14657 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TOR1BO14657 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TOR1BO14657 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TOR1BO14657 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TOR1BO14657 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TOR1BO14657 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TOR1BO14657 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TOR1BO14657 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TOR1BO14657 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TOR1BO14657 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TOR1BO14657 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TOR1BO14657 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TOR1BO14657 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TOR1BO14657 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TOR1BO14657 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TOR1BO14657 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TOR1BO14657 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TOR1BO14657 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TOR1BO14657 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TOR1BO14657 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TOR1BO14657 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TOR1BO14657 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TOR1BO14657 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TOR1BO14657 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TOR1BO14657 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TOR1BO14657 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TOR1BO14657 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TOR1BO14657 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TOR1BO14657 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TOR1BO14657 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TOR1BO14657 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TOR1BO14657 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TOR1BO14657 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TOR1BO14657 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TOR1BO14657 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TOR1BO14657 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TOR1BO14657 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TOR1BO14657 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TOR1BO14657 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TOR1BO14657 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TOR1BO14657 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TOR1BO14657 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TOR1BO14657 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TOR1BO14657 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TOR1BO14657 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TOR1BO14657 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TOR1BO14657 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TOR1BO14657 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TOR1BO14657 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TOR1BO14657 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TOR1BO14657 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TOR1BO14657 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TOR1BO14657 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TOR1BO14657 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TOR1BO14657 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TOR1BO14657 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TOR1BO14657 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TOR1BO14657 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TOR1BO14657 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TOR1BO14657 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TOR1BO14657 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TOR1BO14657 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TOR1BO14657 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TOR1BO14657 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TOR1BO14657 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TOR1BO14657 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TOR1BO14657 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TOR1BO14657 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TOR1BO14657 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TOR1BO14657 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TOR1BO14657 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TOR1BO14657 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TOR1BO14657 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TOR1BO14657 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TOR1BO14657 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TOR1BO14657 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TOR1BO14657 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TOR1BO14657 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TOR1BO14657 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TOR1BO14657 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TOR1BO14657 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TOR1BO14657 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TOR1BO14657 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TOR1BO14657 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TOR1BO14657 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TOR1BO14657 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TOR1BO14657 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TOR1BO14657 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TOR1BO14657 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TOR1BO14657 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TOR1BO14657 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TOR1BO14657 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TOR1BO14657 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TOR1BO14657 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TOR1BO14657 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TOR1BO14657 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms