Protein–RNA interactions for Protein: O00512

BCL9, B-cell CLL/lymphoma 9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL9O00512 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
BCL9O00512 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
BCL9O00512 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
BCL9O00512 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
BCL9O00512 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
BCL9O00512 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
BCL9O00512 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
BCL9O00512 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
BCL9O00512 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
BCL9O00512 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
BCL9O00512 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
BCL9O00512 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
BCL9O00512 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
BCL9O00512 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
BCL9O00512 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
BCL9O00512 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
BCL9O00512 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
BCL9O00512 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
BCL9O00512 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
BCL9O00512 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
BCL9O00512 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
BCL9O00512 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
BCL9O00512 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
BCL9O00512 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
BCL9O00512 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
BCL9O00512 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
BCL9O00512 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
BCL9O00512 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC34.01■■■■□ 3.04
BCL9O00512 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
BCL9O00512 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC34■■■■□ 3.03
BCL9O00512 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
BCL9O00512 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
BCL9O00512 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
BCL9O00512 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
BCL9O00512 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
BCL9O00512 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
BCL9O00512 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
BCL9O00512 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
BCL9O00512 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
BCL9O00512 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
BCL9O00512 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
BCL9O00512 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
BCL9O00512 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
BCL9O00512 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
BCL9O00512 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
BCL9O00512 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC33.95■■■■□ 3.02
BCL9O00512 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC33.95■■■■□ 3.02
BCL9O00512 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
BCL9O00512 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
BCL9O00512 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
BCL9O00512 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
BCL9O00512 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
BCL9O00512 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC33.92■■■■□ 3.02
BCL9O00512 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
BCL9O00512 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
BCL9O00512 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
BCL9O00512 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
BCL9O00512 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
BCL9O00512 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
BCL9O00512 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
BCL9O00512 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
BCL9O00512 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
BCL9O00512 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
BCL9O00512 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
BCL9O00512 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
BCL9O00512 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
BCL9O00512 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
BCL9O00512 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
BCL9O00512 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
BCL9O00512 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
BCL9O00512 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
BCL9O00512 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
BCL9O00512 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
BCL9O00512 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
BCL9O00512 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
BCL9O00512 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
BCL9O00512 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
BCL9O00512 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
BCL9O00512 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
BCL9O00512 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
BCL9O00512 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
BCL9O00512 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
BCL9O00512 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
BCL9O00512 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
BCL9O00512 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC33.78■■■■□ 3
BCL9O00512 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
BCL9O00512 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
BCL9O00512 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
BCL9O00512 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
BCL9O00512 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
BCL9O00512 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
BCL9O00512 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
BCL9O00512 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
BCL9O00512 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
BCL9O00512 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
BCL9O00512 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
BCL9O00512 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
BCL9O00512 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
BCL9O00512 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
BCL9O00512 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms