Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
HHLA1C9JL84 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HHLA1C9JL84 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HHLA1C9JL84 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HHLA1C9JL84 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HHLA1C9JL84 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HHLA1C9JL84 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HHLA1C9JL84 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HHLA1C9JL84 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HHLA1C9JL84 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
HHLA1C9JL84 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HHLA1C9JL84 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HHLA1C9JL84 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HHLA1C9JL84 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HHLA1C9JL84 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HHLA1C9JL84 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HHLA1C9JL84 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HHLA1C9JL84 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HHLA1C9JL84 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HHLA1C9JL84 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HHLA1C9JL84 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HHLA1C9JL84 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HHLA1C9JL84 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
HHLA1C9JL84 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HHLA1C9JL84 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HHLA1C9JL84 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HHLA1C9JL84 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HHLA1C9JL84 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HHLA1C9JL84 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HHLA1C9JL84 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HHLA1C9JL84 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HHLA1C9JL84 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HHLA1C9JL84 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HHLA1C9JL84 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HHLA1C9JL84 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HHLA1C9JL84 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HHLA1C9JL84 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HHLA1C9JL84 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HHLA1C9JL84 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
HHLA1C9JL84 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HHLA1C9JL84 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HHLA1C9JL84 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HHLA1C9JL84 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HHLA1C9JL84 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
HHLA1C9JL84 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HHLA1C9JL84 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HHLA1C9JL84 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
HHLA1C9JL84 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HHLA1C9JL84 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HHLA1C9JL84 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HHLA1C9JL84 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HHLA1C9JL84 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HHLA1C9JL84 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HHLA1C9JL84 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HHLA1C9JL84 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HHLA1C9JL84 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HHLA1C9JL84 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
HHLA1C9JL84 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HHLA1C9JL84 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HHLA1C9JL84 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HHLA1C9JL84 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HHLA1C9JL84 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HHLA1C9JL84 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HHLA1C9JL84 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HHLA1C9JL84 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HHLA1C9JL84 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HHLA1C9JL84 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
HHLA1C9JL84 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
HHLA1C9JL84 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HHLA1C9JL84 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HHLA1C9JL84 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HHLA1C9JL84 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HHLA1C9JL84 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HHLA1C9JL84 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HHLA1C9JL84 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HHLA1C9JL84 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HHLA1C9JL84 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HHLA1C9JL84 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
HHLA1C9JL84 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HHLA1C9JL84 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HHLA1C9JL84 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HHLA1C9JL84 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
HHLA1C9JL84 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HHLA1C9JL84 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HHLA1C9JL84 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HHLA1C9JL84 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HHLA1C9JL84 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HHLA1C9JL84 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HHLA1C9JL84 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
HHLA1C9JL84 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HHLA1C9JL84 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HHLA1C9JL84 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HHLA1C9JL84 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HHLA1C9JL84 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HHLA1C9JL84 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HHLA1C9JL84 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HHLA1C9JL84 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HHLA1C9JL84 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HHLA1C9JL84 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HHLA1C9JL84 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms