Protein–RNA interactions for Protein: A8MYB1

TMCO5B, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5B, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO5BA8MYB1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMCO5BA8MYB1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMCO5BA8MYB1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMCO5BA8MYB1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMCO5BA8MYB1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
TMCO5BA8MYB1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMCO5BA8MYB1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMCO5BA8MYB1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMCO5BA8MYB1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMCO5BA8MYB1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMCO5BA8MYB1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMCO5BA8MYB1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMCO5BA8MYB1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TMCO5BA8MYB1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
TMCO5BA8MYB1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMCO5BA8MYB1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMCO5BA8MYB1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMCO5BA8MYB1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMCO5BA8MYB1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMCO5BA8MYB1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMCO5BA8MYB1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMCO5BA8MYB1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMCO5BA8MYB1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMCO5BA8MYB1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
TMCO5BA8MYB1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMCO5BA8MYB1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMCO5BA8MYB1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMCO5BA8MYB1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMCO5BA8MYB1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMCO5BA8MYB1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMCO5BA8MYB1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
TMCO5BA8MYB1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMCO5BA8MYB1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMCO5BA8MYB1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMCO5BA8MYB1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMCO5BA8MYB1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMCO5BA8MYB1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMCO5BA8MYB1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMCO5BA8MYB1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMCO5BA8MYB1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMCO5BA8MYB1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMCO5BA8MYB1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
TMCO5BA8MYB1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMCO5BA8MYB1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMCO5BA8MYB1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMCO5BA8MYB1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMCO5BA8MYB1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMCO5BA8MYB1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMCO5BA8MYB1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMCO5BA8MYB1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMCO5BA8MYB1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMCO5BA8MYB1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMCO5BA8MYB1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMCO5BA8MYB1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
TMCO5BA8MYB1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMCO5BA8MYB1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMCO5BA8MYB1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMCO5BA8MYB1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMCO5BA8MYB1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMCO5BA8MYB1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMCO5BA8MYB1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMCO5BA8MYB1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMCO5BA8MYB1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMCO5BA8MYB1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
TMCO5BA8MYB1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMCO5BA8MYB1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
TMCO5BA8MYB1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMCO5BA8MYB1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMCO5BA8MYB1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMCO5BA8MYB1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
TMCO5BA8MYB1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMCO5BA8MYB1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMCO5BA8MYB1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMCO5BA8MYB1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMCO5BA8MYB1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMCO5BA8MYB1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMCO5BA8MYB1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMCO5BA8MYB1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
TMCO5BA8MYB1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TMCO5BA8MYB1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TMCO5BA8MYB1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMCO5BA8MYB1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMCO5BA8MYB1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMCO5BA8MYB1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMCO5BA8MYB1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMCO5BA8MYB1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMCO5BA8MYB1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMCO5BA8MYB1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TMCO5BA8MYB1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMCO5BA8MYB1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMCO5BA8MYB1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMCO5BA8MYB1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMCO5BA8MYB1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMCO5BA8MYB1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMCO5BA8MYB1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMCO5BA8MYB1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMCO5BA8MYB1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMCO5BA8MYB1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMCO5BA8MYB1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMCO5BA8MYB1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms