Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SOBPA7XYQ1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SOBPA7XYQ1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SOBPA7XYQ1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SOBPA7XYQ1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SOBPA7XYQ1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SOBPA7XYQ1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SOBPA7XYQ1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SOBPA7XYQ1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SOBPA7XYQ1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SOBPA7XYQ1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SOBPA7XYQ1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SOBPA7XYQ1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SOBPA7XYQ1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SOBPA7XYQ1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SOBPA7XYQ1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SOBPA7XYQ1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SOBPA7XYQ1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SOBPA7XYQ1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SOBPA7XYQ1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SOBPA7XYQ1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SOBPA7XYQ1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SOBPA7XYQ1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SOBPA7XYQ1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SOBPA7XYQ1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SOBPA7XYQ1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SOBPA7XYQ1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SOBPA7XYQ1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SOBPA7XYQ1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SOBPA7XYQ1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SOBPA7XYQ1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SOBPA7XYQ1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SOBPA7XYQ1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SOBPA7XYQ1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SOBPA7XYQ1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SOBPA7XYQ1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SOBPA7XYQ1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SOBPA7XYQ1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SOBPA7XYQ1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SOBPA7XYQ1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SOBPA7XYQ1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SOBPA7XYQ1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
SOBPA7XYQ1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SOBPA7XYQ1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SOBPA7XYQ1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SOBPA7XYQ1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SOBPA7XYQ1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SOBPA7XYQ1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SOBPA7XYQ1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SOBPA7XYQ1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SOBPA7XYQ1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SOBPA7XYQ1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SOBPA7XYQ1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SOBPA7XYQ1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SOBPA7XYQ1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SOBPA7XYQ1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SOBPA7XYQ1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SOBPA7XYQ1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SOBPA7XYQ1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SOBPA7XYQ1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SOBPA7XYQ1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SOBPA7XYQ1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SOBPA7XYQ1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SOBPA7XYQ1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SOBPA7XYQ1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SOBPA7XYQ1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SOBPA7XYQ1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SOBPA7XYQ1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SOBPA7XYQ1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SOBPA7XYQ1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SOBPA7XYQ1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SOBPA7XYQ1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SOBPA7XYQ1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SOBPA7XYQ1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SOBPA7XYQ1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SOBPA7XYQ1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SOBPA7XYQ1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SOBPA7XYQ1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SOBPA7XYQ1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SOBPA7XYQ1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SOBPA7XYQ1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SOBPA7XYQ1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SOBPA7XYQ1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SOBPA7XYQ1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SOBPA7XYQ1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SOBPA7XYQ1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SOBPA7XYQ1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SOBPA7XYQ1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SOBPA7XYQ1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SOBPA7XYQ1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SOBPA7XYQ1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SOBPA7XYQ1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SOBPA7XYQ1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SOBPA7XYQ1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SOBPA7XYQ1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SOBPA7XYQ1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SOBPA7XYQ1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SOBPA7XYQ1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SOBPA7XYQ1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SOBPA7XYQ1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
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