Protein–RNA interactions for Protein: A6NNB3

IFITM5, Interferon-induced transmembrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM5A6NNB3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFITM5A6NNB3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFITM5A6NNB3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFITM5A6NNB3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFITM5A6NNB3 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFITM5A6NNB3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFITM5A6NNB3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFITM5A6NNB3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFITM5A6NNB3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFITM5A6NNB3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFITM5A6NNB3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFITM5A6NNB3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFITM5A6NNB3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFITM5A6NNB3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFITM5A6NNB3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFITM5A6NNB3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFITM5A6NNB3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFITM5A6NNB3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFITM5A6NNB3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFITM5A6NNB3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFITM5A6NNB3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFITM5A6NNB3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFITM5A6NNB3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFITM5A6NNB3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFITM5A6NNB3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFITM5A6NNB3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFITM5A6NNB3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFITM5A6NNB3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFITM5A6NNB3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFITM5A6NNB3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFITM5A6NNB3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFITM5A6NNB3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFITM5A6NNB3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFITM5A6NNB3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFITM5A6NNB3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFITM5A6NNB3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
IFITM5A6NNB3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFITM5A6NNB3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFITM5A6NNB3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFITM5A6NNB3 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFITM5A6NNB3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFITM5A6NNB3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFITM5A6NNB3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFITM5A6NNB3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFITM5A6NNB3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFITM5A6NNB3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFITM5A6NNB3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFITM5A6NNB3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFITM5A6NNB3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFITM5A6NNB3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
IFITM5A6NNB3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFITM5A6NNB3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFITM5A6NNB3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFITM5A6NNB3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFITM5A6NNB3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFITM5A6NNB3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFITM5A6NNB3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFITM5A6NNB3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFITM5A6NNB3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFITM5A6NNB3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFITM5A6NNB3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IFITM5A6NNB3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IFITM5A6NNB3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
IFITM5A6NNB3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IFITM5A6NNB3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFITM5A6NNB3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFITM5A6NNB3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFITM5A6NNB3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFITM5A6NNB3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFITM5A6NNB3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFITM5A6NNB3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFITM5A6NNB3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFITM5A6NNB3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFITM5A6NNB3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
IFITM5A6NNB3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFITM5A6NNB3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFITM5A6NNB3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFITM5A6NNB3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFITM5A6NNB3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFITM5A6NNB3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFITM5A6NNB3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFITM5A6NNB3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFITM5A6NNB3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFITM5A6NNB3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFITM5A6NNB3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFITM5A6NNB3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFITM5A6NNB3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFITM5A6NNB3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFITM5A6NNB3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFITM5A6NNB3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFITM5A6NNB3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFITM5A6NNB3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFITM5A6NNB3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFITM5A6NNB3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFITM5A6NNB3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFITM5A6NNB3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
IFITM5A6NNB3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFITM5A6NNB3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFITM5A6NNB3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFITM5A6NNB3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms