Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
ZNF316A6NFI3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
ZNF316A6NFI3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
ZNF316A6NFI3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
ZNF316A6NFI3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC36.57■■■■□ 3.44
ZNF316A6NFI3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
ZNF316A6NFI3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.56■■■■□ 3.44
ZNF316A6NFI3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
ZNF316A6NFI3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
ZNF316A6NFI3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
ZNF316A6NFI3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
ZNF316A6NFI3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC36.55■■■■□ 3.44
ZNF316A6NFI3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
ZNF316A6NFI3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
ZNF316A6NFI3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
ZNF316A6NFI3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
ZNF316A6NFI3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
ZNF316A6NFI3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
ZNF316A6NFI3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
ZNF316A6NFI3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
ZNF316A6NFI3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
ZNF316A6NFI3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
ZNF316A6NFI3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
ZNF316A6NFI3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC36.52■■■■□ 3.44
ZNF316A6NFI3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
ZNF316A6NFI3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
ZNF316A6NFI3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
ZNF316A6NFI3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
ZNF316A6NFI3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
ZNF316A6NFI3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
ZNF316A6NFI3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
ZNF316A6NFI3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
ZNF316A6NFI3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
ZNF316A6NFI3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
ZNF316A6NFI3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
ZNF316A6NFI3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
ZNF316A6NFI3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
ZNF316A6NFI3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
ZNF316A6NFI3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
ZNF316A6NFI3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.47■■■■□ 3.43
ZNF316A6NFI3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
ZNF316A6NFI3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
ZNF316A6NFI3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
ZNF316A6NFI3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
ZNF316A6NFI3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
ZNF316A6NFI3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
ZNF316A6NFI3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
ZNF316A6NFI3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
ZNF316A6NFI3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
ZNF316A6NFI3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
ZNF316A6NFI3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
ZNF316A6NFI3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
ZNF316A6NFI3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
ZNF316A6NFI3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
ZNF316A6NFI3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
ZNF316A6NFI3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
ZNF316A6NFI3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC36.4■■■■□ 3.42
ZNF316A6NFI3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
ZNF316A6NFI3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
ZNF316A6NFI3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
ZNF316A6NFI3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
ZNF316A6NFI3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
ZNF316A6NFI3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
ZNF316A6NFI3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC36.38■■■■□ 3.41
ZNF316A6NFI3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
ZNF316A6NFI3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
ZNF316A6NFI3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
ZNF316A6NFI3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
ZNF316A6NFI3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
ZNF316A6NFI3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
ZNF316A6NFI3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
ZNF316A6NFI3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
ZNF316A6NFI3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
ZNF316A6NFI3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
ZNF316A6NFI3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
ZNF316A6NFI3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC36.34■■■■□ 3.41
ZNF316A6NFI3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
ZNF316A6NFI3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
ZNF316A6NFI3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
ZNF316A6NFI3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
ZNF316A6NFI3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
ZNF316A6NFI3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
ZNF316A6NFI3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
ZNF316A6NFI3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
ZNF316A6NFI3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
ZNF316A6NFI3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
ZNF316A6NFI3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
ZNF316A6NFI3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
ZNF316A6NFI3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
ZNF316A6NFI3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
ZNF316A6NFI3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC36.24■■■■□ 3.39
ZNF316A6NFI3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
ZNF316A6NFI3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
ZNF316A6NFI3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
ZNF316A6NFI3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
ZNF316A6NFI3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
ZNF316A6NFI3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
ZNF316A6NFI3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
ZNF316A6NFI3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
ZNF316A6NFI3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms