Protein–RNA interactions for Protein: A5PL33

KRBA1, Protein KRBA1, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRBA1A5PL33 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
KRBA1A5PL33 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KRBA1A5PL33 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KRBA1A5PL33 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KRBA1A5PL33 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KRBA1A5PL33 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KRBA1A5PL33 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KRBA1A5PL33 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KRBA1A5PL33 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KRBA1A5PL33 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KRBA1A5PL33 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KRBA1A5PL33 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KRBA1A5PL33 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KRBA1A5PL33 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KRBA1A5PL33 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KRBA1A5PL33 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KRBA1A5PL33 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KRBA1A5PL33 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
KRBA1A5PL33 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KRBA1A5PL33 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KRBA1A5PL33 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KRBA1A5PL33 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KRBA1A5PL33 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
KRBA1A5PL33 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KRBA1A5PL33 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KRBA1A5PL33 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KRBA1A5PL33 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KRBA1A5PL33 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KRBA1A5PL33 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KRBA1A5PL33 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KRBA1A5PL33 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KRBA1A5PL33 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KRBA1A5PL33 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KRBA1A5PL33 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRBA1A5PL33 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRBA1A5PL33 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRBA1A5PL33 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRBA1A5PL33 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRBA1A5PL33 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRBA1A5PL33 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRBA1A5PL33 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
KRBA1A5PL33 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KRBA1A5PL33 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KRBA1A5PL33 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KRBA1A5PL33 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KRBA1A5PL33 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KRBA1A5PL33 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
KRBA1A5PL33 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KRBA1A5PL33 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KRBA1A5PL33 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KRBA1A5PL33 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
KRBA1A5PL33 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KRBA1A5PL33 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KRBA1A5PL33 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
KRBA1A5PL33 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KRBA1A5PL33 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KRBA1A5PL33 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRBA1A5PL33 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRBA1A5PL33 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRBA1A5PL33 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
KRBA1A5PL33 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRBA1A5PL33 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRBA1A5PL33 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRBA1A5PL33 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRBA1A5PL33 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRBA1A5PL33 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KRBA1A5PL33 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KRBA1A5PL33 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KRBA1A5PL33 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KRBA1A5PL33 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KRBA1A5PL33 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
KRBA1A5PL33 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KRBA1A5PL33 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
KRBA1A5PL33 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
KRBA1A5PL33 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRBA1A5PL33 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
KRBA1A5PL33 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
KRBA1A5PL33 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KRBA1A5PL33 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
KRBA1A5PL33 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
KRBA1A5PL33 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KRBA1A5PL33 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KRBA1A5PL33 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KRBA1A5PL33 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KRBA1A5PL33 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KRBA1A5PL33 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KRBA1A5PL33 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KRBA1A5PL33 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KRBA1A5PL33 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KRBA1A5PL33 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KRBA1A5PL33 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KRBA1A5PL33 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
KRBA1A5PL33 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
KRBA1A5PL33 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
KRBA1A5PL33 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KRBA1A5PL33 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
KRBA1A5PL33 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KRBA1A5PL33 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KRBA1A5PL33 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
KRBA1A5PL33 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms