Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
PRAMEF22A3QJZ6 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC33.25■■■□□ 2.91
PRAMEF22A3QJZ6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
PRAMEF22A3QJZ6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
PRAMEF22A3QJZ6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
PRAMEF22A3QJZ6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
PRAMEF22A3QJZ6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC33.23■■■□□ 2.91
PRAMEF22A3QJZ6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
PRAMEF22A3QJZ6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
PRAMEF22A3QJZ6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
PRAMEF22A3QJZ6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
PRAMEF22A3QJZ6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
PRAMEF22A3QJZ6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
PRAMEF22A3QJZ6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
PRAMEF22A3QJZ6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
PRAMEF22A3QJZ6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
PRAMEF22A3QJZ6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PRAMEF22A3QJZ6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PRAMEF22A3QJZ6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PRAMEF22A3QJZ6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC33.17■■■□□ 2.9
PRAMEF22A3QJZ6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
PRAMEF22A3QJZ6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC33.17■■■□□ 2.9
PRAMEF22A3QJZ6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
PRAMEF22A3QJZ6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
PRAMEF22A3QJZ6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
PRAMEF22A3QJZ6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PRAMEF22A3QJZ6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
PRAMEF22A3QJZ6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
PRAMEF22A3QJZ6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
PRAMEF22A3QJZ6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.89
PRAMEF22A3QJZ6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
PRAMEF22A3QJZ6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
PRAMEF22A3QJZ6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PRAMEF22A3QJZ6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PRAMEF22A3QJZ6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
PRAMEF22A3QJZ6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
PRAMEF22A3QJZ6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PRAMEF22A3QJZ6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
PRAMEF22A3QJZ6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
PRAMEF22A3QJZ6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PRAMEF22A3QJZ6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
PRAMEF22A3QJZ6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
PRAMEF22A3QJZ6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
PRAMEF22A3QJZ6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
PRAMEF22A3QJZ6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
PRAMEF22A3QJZ6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
PRAMEF22A3QJZ6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
PRAMEF22A3QJZ6 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
PRAMEF22A3QJZ6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC33.05■■■□□ 2.88
PRAMEF22A3QJZ6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
PRAMEF22A3QJZ6 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PRAMEF22A3QJZ6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
PRAMEF22A3QJZ6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PRAMEF22A3QJZ6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
PRAMEF22A3QJZ6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
PRAMEF22A3QJZ6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
PRAMEF22A3QJZ6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
PRAMEF22A3QJZ6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
PRAMEF22A3QJZ6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
PRAMEF22A3QJZ6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
PRAMEF22A3QJZ6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.01■■■□□ 2.87
PRAMEF22A3QJZ6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
PRAMEF22A3QJZ6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PRAMEF22A3QJZ6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
PRAMEF22A3QJZ6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
PRAMEF22A3QJZ6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
PRAMEF22A3QJZ6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
PRAMEF22A3QJZ6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
PRAMEF22A3QJZ6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
PRAMEF22A3QJZ6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
PRAMEF22A3QJZ6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
PRAMEF22A3QJZ6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
PRAMEF22A3QJZ6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
PRAMEF22A3QJZ6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
PRAMEF22A3QJZ6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PRAMEF22A3QJZ6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PRAMEF22A3QJZ6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
PRAMEF22A3QJZ6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PRAMEF22A3QJZ6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PRAMEF22A3QJZ6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
PRAMEF22A3QJZ6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
PRAMEF22A3QJZ6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.86
PRAMEF22A3QJZ6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
PRAMEF22A3QJZ6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
PRAMEF22A3QJZ6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
PRAMEF22A3QJZ6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
PRAMEF22A3QJZ6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
PRAMEF22A3QJZ6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
PRAMEF22A3QJZ6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
PRAMEF22A3QJZ6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
PRAMEF22A3QJZ6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms