Protein–RNA interactions for Protein: A0PJX4

SHISA3, Protein shisa-3 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA3A0PJX4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHISA3A0PJX4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHISA3A0PJX4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHISA3A0PJX4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SHISA3A0PJX4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHISA3A0PJX4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHISA3A0PJX4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SHISA3A0PJX4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SHISA3A0PJX4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHISA3A0PJX4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHISA3A0PJX4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHISA3A0PJX4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHISA3A0PJX4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHISA3A0PJX4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHISA3A0PJX4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHISA3A0PJX4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHISA3A0PJX4 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHISA3A0PJX4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHISA3A0PJX4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHISA3A0PJX4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHISA3A0PJX4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHISA3A0PJX4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHISA3A0PJX4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHISA3A0PJX4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHISA3A0PJX4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHISA3A0PJX4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHISA3A0PJX4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHISA3A0PJX4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHISA3A0PJX4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHISA3A0PJX4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHISA3A0PJX4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHISA3A0PJX4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHISA3A0PJX4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHISA3A0PJX4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHISA3A0PJX4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHISA3A0PJX4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHISA3A0PJX4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHISA3A0PJX4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHISA3A0PJX4 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHISA3A0PJX4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SHISA3A0PJX4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHISA3A0PJX4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHISA3A0PJX4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHISA3A0PJX4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHISA3A0PJX4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SHISA3A0PJX4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SHISA3A0PJX4 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SHISA3A0PJX4 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SHISA3A0PJX4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SHISA3A0PJX4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SHISA3A0PJX4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHISA3A0PJX4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHISA3A0PJX4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHISA3A0PJX4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHISA3A0PJX4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHISA3A0PJX4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHISA3A0PJX4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHISA3A0PJX4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHISA3A0PJX4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SHISA3A0PJX4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SHISA3A0PJX4 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SHISA3A0PJX4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SHISA3A0PJX4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHISA3A0PJX4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHISA3A0PJX4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHISA3A0PJX4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHISA3A0PJX4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHISA3A0PJX4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SHISA3A0PJX4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SHISA3A0PJX4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SHISA3A0PJX4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SHISA3A0PJX4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SHISA3A0PJX4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SHISA3A0PJX4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHISA3A0PJX4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SHISA3A0PJX4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SHISA3A0PJX4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHISA3A0PJX4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHISA3A0PJX4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SHISA3A0PJX4 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SHISA3A0PJX4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SHISA3A0PJX4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SHISA3A0PJX4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SHISA3A0PJX4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SHISA3A0PJX4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SHISA3A0PJX4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SHISA3A0PJX4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SHISA3A0PJX4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SHISA3A0PJX4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SHISA3A0PJX4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SHISA3A0PJX4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHISA3A0PJX4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHISA3A0PJX4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SHISA3A0PJX4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SHISA3A0PJX4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SHISA3A0PJX4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SHISA3A0PJX4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SHISA3A0PJX4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SHISA3A0PJX4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SHISA3A0PJX4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 175.2 ms