Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GVL5

Uncharacterized protein FLJ43738 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1B0GVL5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
A0A1B0GVL5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
A0A1B0GVL5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
A0A1B0GVL5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
A0A1B0GVL5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
A0A1B0GVL5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
A0A1B0GVL5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
A0A1B0GVL5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
A0A1B0GVL5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
A0A1B0GVL5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
A0A1B0GVL5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
A0A1B0GVL5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
A0A1B0GVL5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
A0A1B0GVL5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
A0A1B0GVL5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
A0A1B0GVL5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
A0A1B0GVL5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
A0A1B0GVL5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
A0A1B0GVL5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
A0A1B0GVL5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
A0A1B0GVL5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
A0A1B0GVL5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
A0A1B0GVL5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
A0A1B0GVL5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
A0A1B0GVL5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
A0A1B0GVL5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
A0A1B0GVL5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
A0A1B0GVL5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
A0A1B0GVL5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
A0A1B0GVL5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
A0A1B0GVL5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
A0A1B0GVL5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
A0A1B0GVL5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
A0A1B0GVL5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
A0A1B0GVL5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
A0A1B0GVL5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
A0A1B0GVL5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
A0A1B0GVL5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
A0A1B0GVL5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
A0A1B0GVL5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
A0A1B0GVL5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
A0A1B0GVL5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29■■■□□ 2.23
A0A1B0GVL5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
A0A1B0GVL5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
A0A1B0GVL5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
A0A1B0GVL5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
A0A1B0GVL5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
A0A1B0GVL5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
A0A1B0GVL5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
A0A1B0GVL5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
A0A1B0GVL5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
A0A1B0GVL5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
A0A1B0GVL5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
A0A1B0GVL5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
A0A1B0GVL5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
A0A1B0GVL5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
A0A1B0GVL5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
A0A1B0GVL5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
A0A1B0GVL5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
A0A1B0GVL5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
A0A1B0GVL5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
A0A1B0GVL5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
A0A1B0GVL5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
A0A1B0GVL5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
A0A1B0GVL5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
A0A1B0GVL5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
A0A1B0GVL5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
A0A1B0GVL5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
A0A1B0GVL5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
A0A1B0GVL5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
A0A1B0GVL5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
A0A1B0GVL5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
A0A1B0GVL5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
A0A1B0GVL5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
A0A1B0GVL5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
A0A1B0GVL5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
A0A1B0GVL5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
A0A1B0GVL5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
A0A1B0GVL5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
A0A1B0GVL5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
A0A1B0GVL5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
A0A1B0GVL5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
A0A1B0GVL5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
A0A1B0GVL5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
A0A1B0GVL5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
A0A1B0GVL5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
A0A1B0GVL5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
A0A1B0GVL5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
A0A1B0GVL5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
A0A1B0GVL5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
A0A1B0GVL5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
A0A1B0GVL5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
A0A1B0GVL5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
A0A1B0GVL5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
A0A1B0GVL5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
A0A1B0GVL5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
A0A1B0GVL5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
A0A1B0GVL5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
A0A1B0GVL5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
A0A1B0GVL5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms